Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGD7

Npas4, Neuronal PAS domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas4Q8BGD7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Npas4Q8BGD7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Npas4Q8BGD7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Npas4Q8BGD7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Npas4Q8BGD7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Npas4Q8BGD7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Npas4Q8BGD7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Npas4Q8BGD7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Npas4Q8BGD7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Npas4Q8BGD7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Npas4Q8BGD7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Npas4Q8BGD7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Npas4Q8BGD7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Npas4Q8BGD7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Npas4Q8BGD7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Npas4Q8BGD7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Npas4Q8BGD7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Npas4Q8BGD7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Npas4Q8BGD7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Npas4Q8BGD7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Npas4Q8BGD7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Npas4Q8BGD7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Npas4Q8BGD7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Npas4Q8BGD7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Npas4Q8BGD7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Npas4Q8BGD7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Npas4Q8BGD7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Npas4Q8BGD7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Npas4Q8BGD7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Npas4Q8BGD7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Npas4Q8BGD7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Npas4Q8BGD7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Npas4Q8BGD7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Npas4Q8BGD7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Npas4Q8BGD7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Npas4Q8BGD7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Npas4Q8BGD7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Npas4Q8BGD7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Npas4Q8BGD7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Npas4Q8BGD7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Npas4Q8BGD7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Npas4Q8BGD7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Npas4Q8BGD7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Npas4Q8BGD7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Npas4Q8BGD7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Npas4Q8BGD7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Npas4Q8BGD7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Npas4Q8BGD7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Npas4Q8BGD7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Npas4Q8BGD7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Npas4Q8BGD7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Npas4Q8BGD7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Npas4Q8BGD7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Npas4Q8BGD7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Npas4Q8BGD7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Npas4Q8BGD7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Npas4Q8BGD7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Npas4Q8BGD7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Npas4Q8BGD7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Npas4Q8BGD7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Npas4Q8BGD7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Npas4Q8BGD7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Npas4Q8BGD7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Npas4Q8BGD7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Npas4Q8BGD7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Npas4Q8BGD7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Npas4Q8BGD7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Npas4Q8BGD7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Npas4Q8BGD7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Npas4Q8BGD7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Npas4Q8BGD7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Npas4Q8BGD7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Npas4Q8BGD7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Npas4Q8BGD7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Npas4Q8BGD7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Npas4Q8BGD7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Npas4Q8BGD7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Npas4Q8BGD7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Npas4Q8BGD7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Npas4Q8BGD7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Npas4Q8BGD7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Npas4Q8BGD7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Npas4Q8BGD7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Npas4Q8BGD7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Npas4Q8BGD7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Npas4Q8BGD7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Npas4Q8BGD7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Npas4Q8BGD7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Npas4Q8BGD7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Npas4Q8BGD7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Npas4Q8BGD7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Npas4Q8BGD7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Npas4Q8BGD7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Npas4Q8BGD7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Npas4Q8BGD7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Npas4Q8BGD7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Npas4Q8BGD7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Npas4Q8BGD7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Npas4Q8BGD7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Npas4Q8BGD7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms