Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q8BGC1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q8BGC1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q8BGC1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q8BGC1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Q8BGC1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q8BGC1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q8BGC1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q8BGC1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q8BGC1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q8BGC1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q8BGC1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q8BGC1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q8BGC1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q8BGC1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q8BGC1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q8BGC1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q8BGC1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q8BGC1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q8BGC1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Q8BGC1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q8BGC1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q8BGC1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q8BGC1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q8BGC1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q8BGC1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q8BGC1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q8BGC1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q8BGC1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q8BGC1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Q8BGC1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q8BGC1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q8BGC1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q8BGC1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q8BGC1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q8BGC1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Q8BGC1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q8BGC1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q8BGC1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Q8BGC1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Q8BGC1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q8BGC1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Q8BGC1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q8BGC1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q8BGC1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Q8BGC1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Q8BGC1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q8BGC1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q8BGC1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q8BGC1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q8BGC1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q8BGC1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q8BGC1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q8BGC1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q8BGC1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q8BGC1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Q8BGC1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q8BGC1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q8BGC1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q8BGC1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q8BGC1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q8BGC1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q8BGC1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q8BGC1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q8BGC1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q8BGC1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q8BGC1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q8BGC1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q8BGC1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q8BGC1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q8BGC1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q8BGC1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q8BGC1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q8BGC1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q8BGC1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q8BGC1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q8BGC1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q8BGC1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Q8BGC1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q8BGC1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q8BGC1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q8BGC1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q8BGC1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q8BGC1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q8BGC1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q8BGC1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q8BGC1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Q8BGC1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Q8BGC1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Q8BGC1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Q8BGC1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q8BGC1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q8BGC1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q8BGC1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q8BGC1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q8BGC1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Q8BGC1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q8BGC1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q8BGC1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q8BGC1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms