Protein–RNA interactions for Protein: Q86UA6

RPAIN, RPA-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAINQ86UA6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RPAINQ86UA6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RPAINQ86UA6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RPAINQ86UA6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RPAINQ86UA6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RPAINQ86UA6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RPAINQ86UA6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RPAINQ86UA6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RPAINQ86UA6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RPAINQ86UA6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RPAINQ86UA6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RPAINQ86UA6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RPAINQ86UA6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RPAINQ86UA6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RPAINQ86UA6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RPAINQ86UA6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RPAINQ86UA6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RPAINQ86UA6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RPAINQ86UA6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RPAINQ86UA6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RPAINQ86UA6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RPAINQ86UA6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
RPAINQ86UA6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RPAINQ86UA6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RPAINQ86UA6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RPAINQ86UA6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RPAINQ86UA6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RPAINQ86UA6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
RPAINQ86UA6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RPAINQ86UA6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RPAINQ86UA6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RPAINQ86UA6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RPAINQ86UA6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RPAINQ86UA6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RPAINQ86UA6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RPAINQ86UA6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPAINQ86UA6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPAINQ86UA6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPAINQ86UA6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
RPAINQ86UA6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
RPAINQ86UA6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPAINQ86UA6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPAINQ86UA6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPAINQ86UA6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPAINQ86UA6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPAINQ86UA6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPAINQ86UA6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPAINQ86UA6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPAINQ86UA6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPAINQ86UA6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPAINQ86UA6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPAINQ86UA6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPAINQ86UA6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPAINQ86UA6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RPAINQ86UA6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RPAINQ86UA6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RPAINQ86UA6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RPAINQ86UA6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RPAINQ86UA6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RPAINQ86UA6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPAINQ86UA6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPAINQ86UA6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPAINQ86UA6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPAINQ86UA6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPAINQ86UA6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPAINQ86UA6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPAINQ86UA6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPAINQ86UA6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPAINQ86UA6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPAINQ86UA6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPAINQ86UA6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPAINQ86UA6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPAINQ86UA6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPAINQ86UA6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPAINQ86UA6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPAINQ86UA6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPAINQ86UA6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
RPAINQ86UA6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
RPAINQ86UA6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPAINQ86UA6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPAINQ86UA6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPAINQ86UA6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPAINQ86UA6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPAINQ86UA6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPAINQ86UA6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPAINQ86UA6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPAINQ86UA6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPAINQ86UA6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPAINQ86UA6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPAINQ86UA6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPAINQ86UA6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPAINQ86UA6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPAINQ86UA6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPAINQ86UA6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPAINQ86UA6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPAINQ86UA6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPAINQ86UA6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPAINQ86UA6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPAINQ86UA6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPAINQ86UA6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms