Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttc28Q80XJ3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttc28Q80XJ3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttc28Q80XJ3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttc28Q80XJ3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttc28Q80XJ3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttc28Q80XJ3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttc28Q80XJ3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttc28Q80XJ3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttc28Q80XJ3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttc28Q80XJ3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttc28Q80XJ3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttc28Q80XJ3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc28Q80XJ3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc28Q80XJ3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc28Q80XJ3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttc28Q80XJ3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttc28Q80XJ3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttc28Q80XJ3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttc28Q80XJ3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ttc28Q80XJ3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ttc28Q80XJ3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttc28Q80XJ3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttc28Q80XJ3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttc28Q80XJ3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttc28Q80XJ3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttc28Q80XJ3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttc28Q80XJ3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttc28Q80XJ3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttc28Q80XJ3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttc28Q80XJ3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttc28Q80XJ3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttc28Q80XJ3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttc28Q80XJ3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttc28Q80XJ3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttc28Q80XJ3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttc28Q80XJ3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttc28Q80XJ3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttc28Q80XJ3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttc28Q80XJ3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttc28Q80XJ3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttc28Q80XJ3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttc28Q80XJ3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttc28Q80XJ3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttc28Q80XJ3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttc28Q80XJ3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttc28Q80XJ3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttc28Q80XJ3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttc28Q80XJ3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttc28Q80XJ3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttc28Q80XJ3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttc28Q80XJ3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttc28Q80XJ3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttc28Q80XJ3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttc28Q80XJ3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttc28Q80XJ3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttc28Q80XJ3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttc28Q80XJ3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttc28Q80XJ3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttc28Q80XJ3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttc28Q80XJ3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ttc28Q80XJ3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ttc28Q80XJ3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ttc28Q80XJ3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ttc28Q80XJ3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ttc28Q80XJ3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttc28Q80XJ3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttc28Q80XJ3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttc28Q80XJ3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttc28Q80XJ3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttc28Q80XJ3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttc28Q80XJ3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttc28Q80XJ3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttc28Q80XJ3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttc28Q80XJ3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttc28Q80XJ3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttc28Q80XJ3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttc28Q80XJ3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttc28Q80XJ3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttc28Q80XJ3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttc28Q80XJ3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttc28Q80XJ3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttc28Q80XJ3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttc28Q80XJ3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttc28Q80XJ3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttc28Q80XJ3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttc28Q80XJ3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttc28Q80XJ3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttc28Q80XJ3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttc28Q80XJ3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttc28Q80XJ3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttc28Q80XJ3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttc28Q80XJ3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttc28Q80XJ3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttc28Q80XJ3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttc28Q80XJ3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttc28Q80XJ3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttc28Q80XJ3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttc28Q80XJ3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttc28Q80XJ3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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