Protein–RNA interactions for Protein: Q80UN9

Trit1, tRNA dimethylallyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trit1Q80UN9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Trit1Q80UN9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trit1Q80UN9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trit1Q80UN9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trit1Q80UN9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trit1Q80UN9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trit1Q80UN9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trit1Q80UN9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trit1Q80UN9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trit1Q80UN9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trit1Q80UN9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trit1Q80UN9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trit1Q80UN9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trit1Q80UN9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trit1Q80UN9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trit1Q80UN9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Trit1Q80UN9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trit1Q80UN9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trit1Q80UN9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trit1Q80UN9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trit1Q80UN9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trit1Q80UN9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trit1Q80UN9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trit1Q80UN9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trit1Q80UN9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trit1Q80UN9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trit1Q80UN9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trit1Q80UN9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Trit1Q80UN9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Trit1Q80UN9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trit1Q80UN9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trit1Q80UN9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trit1Q80UN9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trit1Q80UN9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trit1Q80UN9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Trit1Q80UN9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trit1Q80UN9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trit1Q80UN9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trit1Q80UN9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trit1Q80UN9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trit1Q80UN9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trit1Q80UN9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trit1Q80UN9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trit1Q80UN9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trit1Q80UN9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trit1Q80UN9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trit1Q80UN9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trit1Q80UN9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Trit1Q80UN9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trit1Q80UN9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trit1Q80UN9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trit1Q80UN9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trit1Q80UN9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trit1Q80UN9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trit1Q80UN9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trit1Q80UN9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trit1Q80UN9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trit1Q80UN9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trit1Q80UN9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Trit1Q80UN9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trit1Q80UN9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trit1Q80UN9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trit1Q80UN9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trit1Q80UN9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trit1Q80UN9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trit1Q80UN9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trit1Q80UN9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trit1Q80UN9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trit1Q80UN9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trit1Q80UN9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Trit1Q80UN9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trit1Q80UN9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trit1Q80UN9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trit1Q80UN9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trit1Q80UN9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trit1Q80UN9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trit1Q80UN9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trit1Q80UN9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trit1Q80UN9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trit1Q80UN9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trit1Q80UN9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trit1Q80UN9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trit1Q80UN9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trit1Q80UN9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Trit1Q80UN9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trit1Q80UN9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trit1Q80UN9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trit1Q80UN9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trit1Q80UN9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trit1Q80UN9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trit1Q80UN9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trit1Q80UN9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trit1Q80UN9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trit1Q80UN9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trit1Q80UN9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trit1Q80UN9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trit1Q80UN9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trit1Q80UN9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trit1Q80UN9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trit1Q80UN9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms