Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7A3

CTU1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU1Q7Z7A3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CTU1Q7Z7A3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CTU1Q7Z7A3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CTU1Q7Z7A3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CTU1Q7Z7A3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CTU1Q7Z7A3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CTU1Q7Z7A3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CTU1Q7Z7A3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CTU1Q7Z7A3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CTU1Q7Z7A3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CTU1Q7Z7A3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CTU1Q7Z7A3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CTU1Q7Z7A3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CTU1Q7Z7A3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CTU1Q7Z7A3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CTU1Q7Z7A3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CTU1Q7Z7A3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CTU1Q7Z7A3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CTU1Q7Z7A3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CTU1Q7Z7A3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CTU1Q7Z7A3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CTU1Q7Z7A3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CTU1Q7Z7A3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CTU1Q7Z7A3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CTU1Q7Z7A3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CTU1Q7Z7A3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CTU1Q7Z7A3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CTU1Q7Z7A3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CTU1Q7Z7A3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CTU1Q7Z7A3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CTU1Q7Z7A3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CTU1Q7Z7A3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CTU1Q7Z7A3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CTU1Q7Z7A3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CTU1Q7Z7A3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CTU1Q7Z7A3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CTU1Q7Z7A3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CTU1Q7Z7A3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CTU1Q7Z7A3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CTU1Q7Z7A3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CTU1Q7Z7A3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CTU1Q7Z7A3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CTU1Q7Z7A3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CTU1Q7Z7A3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CTU1Q7Z7A3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CTU1Q7Z7A3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CTU1Q7Z7A3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CTU1Q7Z7A3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CTU1Q7Z7A3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CTU1Q7Z7A3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CTU1Q7Z7A3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CTU1Q7Z7A3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CTU1Q7Z7A3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTU1Q7Z7A3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTU1Q7Z7A3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTU1Q7Z7A3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTU1Q7Z7A3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTU1Q7Z7A3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CTU1Q7Z7A3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTU1Q7Z7A3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTU1Q7Z7A3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CTU1Q7Z7A3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CTU1Q7Z7A3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CTU1Q7Z7A3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CTU1Q7Z7A3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CTU1Q7Z7A3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CTU1Q7Z7A3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CTU1Q7Z7A3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CTU1Q7Z7A3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CTU1Q7Z7A3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CTU1Q7Z7A3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CTU1Q7Z7A3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CTU1Q7Z7A3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CTU1Q7Z7A3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CTU1Q7Z7A3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CTU1Q7Z7A3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CTU1Q7Z7A3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CTU1Q7Z7A3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CTU1Q7Z7A3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CTU1Q7Z7A3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CTU1Q7Z7A3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CTU1Q7Z7A3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CTU1Q7Z7A3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CTU1Q7Z7A3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CTU1Q7Z7A3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CTU1Q7Z7A3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CTU1Q7Z7A3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CTU1Q7Z7A3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CTU1Q7Z7A3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CTU1Q7Z7A3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTU1Q7Z7A3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTU1Q7Z7A3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTU1Q7Z7A3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTU1Q7Z7A3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTU1Q7Z7A3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTU1Q7Z7A3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTU1Q7Z7A3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTU1Q7Z7A3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CTU1Q7Z7A3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CTU1Q7Z7A3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms