Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNB8

Sbno2, Protein strawberry notch homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno2Q7TNB8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sbno2Q7TNB8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Sbno2Q7TNB8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sbno2Q7TNB8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Sbno2Q7TNB8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sbno2Q7TNB8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sbno2Q7TNB8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sbno2Q7TNB8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sbno2Q7TNB8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sbno2Q7TNB8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sbno2Q7TNB8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sbno2Q7TNB8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sbno2Q7TNB8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sbno2Q7TNB8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sbno2Q7TNB8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sbno2Q7TNB8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sbno2Q7TNB8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sbno2Q7TNB8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Sbno2Q7TNB8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Sbno2Q7TNB8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Sbno2Q7TNB8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Sbno2Q7TNB8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sbno2Q7TNB8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sbno2Q7TNB8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sbno2Q7TNB8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Sbno2Q7TNB8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Sbno2Q7TNB8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Sbno2Q7TNB8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sbno2Q7TNB8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sbno2Q7TNB8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sbno2Q7TNB8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sbno2Q7TNB8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sbno2Q7TNB8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sbno2Q7TNB8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sbno2Q7TNB8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sbno2Q7TNB8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sbno2Q7TNB8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sbno2Q7TNB8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sbno2Q7TNB8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sbno2Q7TNB8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sbno2Q7TNB8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sbno2Q7TNB8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sbno2Q7TNB8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sbno2Q7TNB8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sbno2Q7TNB8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sbno2Q7TNB8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sbno2Q7TNB8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sbno2Q7TNB8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sbno2Q7TNB8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sbno2Q7TNB8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sbno2Q7TNB8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Sbno2Q7TNB8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sbno2Q7TNB8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sbno2Q7TNB8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sbno2Q7TNB8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sbno2Q7TNB8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sbno2Q7TNB8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sbno2Q7TNB8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sbno2Q7TNB8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Sbno2Q7TNB8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sbno2Q7TNB8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sbno2Q7TNB8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sbno2Q7TNB8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sbno2Q7TNB8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sbno2Q7TNB8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sbno2Q7TNB8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sbno2Q7TNB8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sbno2Q7TNB8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Sbno2Q7TNB8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Sbno2Q7TNB8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sbno2Q7TNB8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sbno2Q7TNB8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sbno2Q7TNB8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Sbno2Q7TNB8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sbno2Q7TNB8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sbno2Q7TNB8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sbno2Q7TNB8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sbno2Q7TNB8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sbno2Q7TNB8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sbno2Q7TNB8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sbno2Q7TNB8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sbno2Q7TNB8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sbno2Q7TNB8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sbno2Q7TNB8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Sbno2Q7TNB8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sbno2Q7TNB8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Sbno2Q7TNB8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sbno2Q7TNB8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sbno2Q7TNB8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sbno2Q7TNB8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sbno2Q7TNB8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sbno2Q7TNB8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sbno2Q7TNB8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sbno2Q7TNB8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sbno2Q7TNB8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sbno2Q7TNB8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sbno2Q7TNB8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sbno2Q7TNB8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sbno2Q7TNB8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sbno2Q7TNB8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms