Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CATSPER4Q7RTX7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CATSPER4Q7RTX7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CATSPER4Q7RTX7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CATSPER4Q7RTX7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CATSPER4Q7RTX7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CATSPER4Q7RTX7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CATSPER4Q7RTX7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CATSPER4Q7RTX7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CATSPER4Q7RTX7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CATSPER4Q7RTX7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CATSPER4Q7RTX7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CATSPER4Q7RTX7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CATSPER4Q7RTX7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CATSPER4Q7RTX7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CATSPER4Q7RTX7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CATSPER4Q7RTX7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CATSPER4Q7RTX7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CATSPER4Q7RTX7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CATSPER4Q7RTX7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CATSPER4Q7RTX7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CATSPER4Q7RTX7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CATSPER4Q7RTX7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CATSPER4Q7RTX7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CATSPER4Q7RTX7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CATSPER4Q7RTX7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CATSPER4Q7RTX7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CATSPER4Q7RTX7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CATSPER4Q7RTX7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CATSPER4Q7RTX7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CATSPER4Q7RTX7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CATSPER4Q7RTX7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CATSPER4Q7RTX7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CATSPER4Q7RTX7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CATSPER4Q7RTX7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CATSPER4Q7RTX7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CATSPER4Q7RTX7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CATSPER4Q7RTX7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CATSPER4Q7RTX7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CATSPER4Q7RTX7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CATSPER4Q7RTX7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CATSPER4Q7RTX7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CATSPER4Q7RTX7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CATSPER4Q7RTX7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CATSPER4Q7RTX7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CATSPER4Q7RTX7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CATSPER4Q7RTX7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CATSPER4Q7RTX7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CATSPER4Q7RTX7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CATSPER4Q7RTX7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CATSPER4Q7RTX7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CATSPER4Q7RTX7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CATSPER4Q7RTX7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CATSPER4Q7RTX7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CATSPER4Q7RTX7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CATSPER4Q7RTX7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CATSPER4Q7RTX7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CATSPER4Q7RTX7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CATSPER4Q7RTX7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CATSPER4Q7RTX7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CATSPER4Q7RTX7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CATSPER4Q7RTX7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CATSPER4Q7RTX7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CATSPER4Q7RTX7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CATSPER4Q7RTX7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CATSPER4Q7RTX7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CATSPER4Q7RTX7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CATSPER4Q7RTX7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CATSPER4Q7RTX7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CATSPER4Q7RTX7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CATSPER4Q7RTX7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CATSPER4Q7RTX7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CATSPER4Q7RTX7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CATSPER4Q7RTX7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CATSPER4Q7RTX7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CATSPER4Q7RTX7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CATSPER4Q7RTX7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CATSPER4Q7RTX7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CATSPER4Q7RTX7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CATSPER4Q7RTX7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CATSPER4Q7RTX7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CATSPER4Q7RTX7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CATSPER4Q7RTX7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CATSPER4Q7RTX7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CATSPER4Q7RTX7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CATSPER4Q7RTX7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CATSPER4Q7RTX7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CATSPER4Q7RTX7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CATSPER4Q7RTX7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CATSPER4Q7RTX7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CATSPER4Q7RTX7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CATSPER4Q7RTX7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CATSPER4Q7RTX7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CATSPER4Q7RTX7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CATSPER4Q7RTX7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CATSPER4Q7RTX7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CATSPER4Q7RTX7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CATSPER4Q7RTX7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CATSPER4Q7RTX7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CATSPER4Q7RTX7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 232.7 ms