Protein–RNA interactions for Protein: Q7JJ13

Brd2, Bromodomain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd2Q7JJ13 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Brd2Q7JJ13 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Brd2Q7JJ13 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Brd2Q7JJ13 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Brd2Q7JJ13 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Brd2Q7JJ13 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Brd2Q7JJ13 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Brd2Q7JJ13 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Brd2Q7JJ13 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Brd2Q7JJ13 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Brd2Q7JJ13 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Brd2Q7JJ13 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Brd2Q7JJ13 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Brd2Q7JJ13 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Brd2Q7JJ13 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Brd2Q7JJ13 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Brd2Q7JJ13 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Brd2Q7JJ13 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Brd2Q7JJ13 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Brd2Q7JJ13 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Brd2Q7JJ13 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Brd2Q7JJ13 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Brd2Q7JJ13 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Brd2Q7JJ13 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Brd2Q7JJ13 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Brd2Q7JJ13 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Brd2Q7JJ13 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Brd2Q7JJ13 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Brd2Q7JJ13 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Brd2Q7JJ13 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Brd2Q7JJ13 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Brd2Q7JJ13 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Brd2Q7JJ13 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Brd2Q7JJ13 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Brd2Q7JJ13 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Brd2Q7JJ13 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Brd2Q7JJ13 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Brd2Q7JJ13 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Brd2Q7JJ13 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Brd2Q7JJ13 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Brd2Q7JJ13 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Brd2Q7JJ13 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Brd2Q7JJ13 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Brd2Q7JJ13 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Brd2Q7JJ13 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Brd2Q7JJ13 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Brd2Q7JJ13 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Brd2Q7JJ13 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Brd2Q7JJ13 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Brd2Q7JJ13 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Brd2Q7JJ13 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Brd2Q7JJ13 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Brd2Q7JJ13 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Brd2Q7JJ13 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Brd2Q7JJ13 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Brd2Q7JJ13 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Brd2Q7JJ13 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Brd2Q7JJ13 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Brd2Q7JJ13 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Brd2Q7JJ13 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Brd2Q7JJ13 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Brd2Q7JJ13 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Brd2Q7JJ13 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Brd2Q7JJ13 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Brd2Q7JJ13 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Brd2Q7JJ13 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Brd2Q7JJ13 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Brd2Q7JJ13 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Brd2Q7JJ13 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Brd2Q7JJ13 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Brd2Q7JJ13 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Brd2Q7JJ13 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Brd2Q7JJ13 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Brd2Q7JJ13 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Brd2Q7JJ13 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Brd2Q7JJ13 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Brd2Q7JJ13 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Brd2Q7JJ13 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Brd2Q7JJ13 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Brd2Q7JJ13 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Brd2Q7JJ13 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Brd2Q7JJ13 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Brd2Q7JJ13 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Brd2Q7JJ13 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Brd2Q7JJ13 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Brd2Q7JJ13 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Brd2Q7JJ13 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Brd2Q7JJ13 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Brd2Q7JJ13 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Brd2Q7JJ13 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Brd2Q7JJ13 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Brd2Q7JJ13 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Brd2Q7JJ13 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Brd2Q7JJ13 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Brd2Q7JJ13 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Brd2Q7JJ13 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Brd2Q7JJ13 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Brd2Q7JJ13 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Brd2Q7JJ13 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Brd2Q7JJ13 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms