Protein–RNA interactions for Protein: Q76NI1

KNDC1, Protein very KIND, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNDC1Q76NI1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
KNDC1Q76NI1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC33.39■■■□□ 2.94
KNDC1Q76NI1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
KNDC1Q76NI1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
KNDC1Q76NI1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
KNDC1Q76NI1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
KNDC1Q76NI1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
KNDC1Q76NI1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
KNDC1Q76NI1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
KNDC1Q76NI1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
KNDC1Q76NI1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
KNDC1Q76NI1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC33.37■■■□□ 2.93
KNDC1Q76NI1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
KNDC1Q76NI1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
KNDC1Q76NI1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
KNDC1Q76NI1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
KNDC1Q76NI1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
KNDC1Q76NI1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
KNDC1Q76NI1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
KNDC1Q76NI1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
KNDC1Q76NI1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
KNDC1Q76NI1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
KNDC1Q76NI1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
KNDC1Q76NI1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
KNDC1Q76NI1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
KNDC1Q76NI1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
KNDC1Q76NI1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
KNDC1Q76NI1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
KNDC1Q76NI1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
KNDC1Q76NI1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
KNDC1Q76NI1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
KNDC1Q76NI1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
KNDC1Q76NI1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
KNDC1Q76NI1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
KNDC1Q76NI1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
KNDC1Q76NI1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
KNDC1Q76NI1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
KNDC1Q76NI1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
KNDC1Q76NI1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
KNDC1Q76NI1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
KNDC1Q76NI1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
KNDC1Q76NI1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
KNDC1Q76NI1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
KNDC1Q76NI1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
KNDC1Q76NI1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC33.3■■■□□ 2.92
KNDC1Q76NI1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
KNDC1Q76NI1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
KNDC1Q76NI1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
KNDC1Q76NI1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
KNDC1Q76NI1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
KNDC1Q76NI1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
KNDC1Q76NI1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC33.28■■■□□ 2.92
KNDC1Q76NI1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
KNDC1Q76NI1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
KNDC1Q76NI1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
KNDC1Q76NI1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
KNDC1Q76NI1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
KNDC1Q76NI1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
KNDC1Q76NI1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
KNDC1Q76NI1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
KNDC1Q76NI1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
KNDC1Q76NI1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
KNDC1Q76NI1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
KNDC1Q76NI1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
KNDC1Q76NI1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
KNDC1Q76NI1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
KNDC1Q76NI1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
KNDC1Q76NI1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
KNDC1Q76NI1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
KNDC1Q76NI1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
KNDC1Q76NI1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
KNDC1Q76NI1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
KNDC1Q76NI1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
KNDC1Q76NI1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
KNDC1Q76NI1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
KNDC1Q76NI1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
KNDC1Q76NI1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
KNDC1Q76NI1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
KNDC1Q76NI1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
KNDC1Q76NI1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
KNDC1Q76NI1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
KNDC1Q76NI1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
KNDC1Q76NI1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
KNDC1Q76NI1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
KNDC1Q76NI1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
KNDC1Q76NI1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
KNDC1Q76NI1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
KNDC1Q76NI1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
KNDC1Q76NI1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
KNDC1Q76NI1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
KNDC1Q76NI1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
KNDC1Q76NI1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
KNDC1Q76NI1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
KNDC1Q76NI1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
KNDC1Q76NI1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
KNDC1Q76NI1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
KNDC1Q76NI1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
KNDC1Q76NI1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
KNDC1Q76NI1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
KNDC1Q76NI1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms