Protein–RNA interactions for Protein: Q712K3

UBE2R2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2R2Q712K3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE2R2Q712K3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBE2R2Q712K3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBE2R2Q712K3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBE2R2Q712K3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBE2R2Q712K3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
UBE2R2Q712K3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
UBE2R2Q712K3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE2R2Q712K3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE2R2Q712K3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE2R2Q712K3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE2R2Q712K3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE2R2Q712K3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE2R2Q712K3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE2R2Q712K3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE2R2Q712K3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE2R2Q712K3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE2R2Q712K3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE2R2Q712K3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE2R2Q712K3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE2R2Q712K3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE2R2Q712K3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE2R2Q712K3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE2R2Q712K3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE2R2Q712K3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE2R2Q712K3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE2R2Q712K3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE2R2Q712K3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE2R2Q712K3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE2R2Q712K3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE2R2Q712K3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE2R2Q712K3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE2R2Q712K3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE2R2Q712K3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE2R2Q712K3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE2R2Q712K3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE2R2Q712K3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBE2R2Q712K3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBE2R2Q712K3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE2R2Q712K3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE2R2Q712K3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE2R2Q712K3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE2R2Q712K3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE2R2Q712K3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE2R2Q712K3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE2R2Q712K3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBE2R2Q712K3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBE2R2Q712K3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
UBE2R2Q712K3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBE2R2Q712K3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
UBE2R2Q712K3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBE2R2Q712K3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE2R2Q712K3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE2R2Q712K3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE2R2Q712K3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE2R2Q712K3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE2R2Q712K3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE2R2Q712K3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE2R2Q712K3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBE2R2Q712K3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBE2R2Q712K3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBE2R2Q712K3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
UBE2R2Q712K3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBE2R2Q712K3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBE2R2Q712K3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
UBE2R2Q712K3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23■■□□□ 1.27
UBE2R2Q712K3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBE2R2Q712K3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE2R2Q712K3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE2R2Q712K3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE2R2Q712K3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE2R2Q712K3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE2R2Q712K3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE2R2Q712K3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE2R2Q712K3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE2R2Q712K3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE2R2Q712K3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE2R2Q712K3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE2R2Q712K3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE2R2Q712K3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE2R2Q712K3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE2R2Q712K3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE2R2Q712K3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE2R2Q712K3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE2R2Q712K3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE2R2Q712K3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE2R2Q712K3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE2R2Q712K3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE2R2Q712K3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE2R2Q712K3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE2R2Q712K3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE2R2Q712K3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE2R2Q712K3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE2R2Q712K3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE2R2Q712K3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE2R2Q712K3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE2R2Q712K3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE2R2Q712K3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE2R2Q712K3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE2R2Q712K3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 304.1 ms