Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ1

USP49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, humanhuman

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Length 688 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP49Q70CQ1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP49Q70CQ1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP49Q70CQ1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP49Q70CQ1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP49Q70CQ1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP49Q70CQ1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP49Q70CQ1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP49Q70CQ1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP49Q70CQ1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP49Q70CQ1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP49Q70CQ1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
USP49Q70CQ1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP49Q70CQ1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP49Q70CQ1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP49Q70CQ1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP49Q70CQ1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP49Q70CQ1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP49Q70CQ1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
USP49Q70CQ1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP49Q70CQ1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP49Q70CQ1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP49Q70CQ1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
USP49Q70CQ1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
USP49Q70CQ1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP49Q70CQ1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
USP49Q70CQ1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP49Q70CQ1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP49Q70CQ1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP49Q70CQ1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP49Q70CQ1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP49Q70CQ1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP49Q70CQ1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP49Q70CQ1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP49Q70CQ1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP49Q70CQ1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP49Q70CQ1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP49Q70CQ1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
USP49Q70CQ1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP49Q70CQ1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP49Q70CQ1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP49Q70CQ1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
USP49Q70CQ1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP49Q70CQ1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP49Q70CQ1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
USP49Q70CQ1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP49Q70CQ1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP49Q70CQ1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP49Q70CQ1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP49Q70CQ1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP49Q70CQ1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP49Q70CQ1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP49Q70CQ1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
USP49Q70CQ1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
USP49Q70CQ1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
USP49Q70CQ1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP49Q70CQ1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP49Q70CQ1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
USP49Q70CQ1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP49Q70CQ1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP49Q70CQ1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP49Q70CQ1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP49Q70CQ1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP49Q70CQ1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
USP49Q70CQ1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP49Q70CQ1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP49Q70CQ1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP49Q70CQ1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP49Q70CQ1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP49Q70CQ1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP49Q70CQ1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
USP49Q70CQ1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP49Q70CQ1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
USP49Q70CQ1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP49Q70CQ1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP49Q70CQ1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP49Q70CQ1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP49Q70CQ1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP49Q70CQ1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP49Q70CQ1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP49Q70CQ1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP49Q70CQ1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP49Q70CQ1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP49Q70CQ1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
USP49Q70CQ1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP49Q70CQ1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
USP49Q70CQ1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP49Q70CQ1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP49Q70CQ1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP49Q70CQ1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP49Q70CQ1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP49Q70CQ1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP49Q70CQ1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP49Q70CQ1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP49Q70CQ1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP49Q70CQ1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
USP49Q70CQ1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP49Q70CQ1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP49Q70CQ1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP49Q70CQ1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP49Q70CQ1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
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