Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV50

RFX8, DNA-binding protein RFX8, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX8Q6ZV50 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFX8Q6ZV50 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFX8Q6ZV50 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFX8Q6ZV50 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFX8Q6ZV50 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFX8Q6ZV50 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFX8Q6ZV50 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFX8Q6ZV50 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFX8Q6ZV50 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFX8Q6ZV50 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFX8Q6ZV50 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RFX8Q6ZV50 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RFX8Q6ZV50 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RFX8Q6ZV50 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RFX8Q6ZV50 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RFX8Q6ZV50 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RFX8Q6ZV50 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RFX8Q6ZV50 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RFX8Q6ZV50 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RFX8Q6ZV50 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RFX8Q6ZV50 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RFX8Q6ZV50 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RFX8Q6ZV50 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RFX8Q6ZV50 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RFX8Q6ZV50 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RFX8Q6ZV50 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RFX8Q6ZV50 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RFX8Q6ZV50 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RFX8Q6ZV50 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RFX8Q6ZV50 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RFX8Q6ZV50 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RFX8Q6ZV50 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RFX8Q6ZV50 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RFX8Q6ZV50 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RFX8Q6ZV50 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RFX8Q6ZV50 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RFX8Q6ZV50 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RFX8Q6ZV50 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RFX8Q6ZV50 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RFX8Q6ZV50 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RFX8Q6ZV50 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RFX8Q6ZV50 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RFX8Q6ZV50 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RFX8Q6ZV50 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RFX8Q6ZV50 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RFX8Q6ZV50 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RFX8Q6ZV50 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RFX8Q6ZV50 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RFX8Q6ZV50 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RFX8Q6ZV50 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RFX8Q6ZV50 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFX8Q6ZV50 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFX8Q6ZV50 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFX8Q6ZV50 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFX8Q6ZV50 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFX8Q6ZV50 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFX8Q6ZV50 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFX8Q6ZV50 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RFX8Q6ZV50 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RFX8Q6ZV50 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RFX8Q6ZV50 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RFX8Q6ZV50 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RFX8Q6ZV50 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RFX8Q6ZV50 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RFX8Q6ZV50 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RFX8Q6ZV50 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RFX8Q6ZV50 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RFX8Q6ZV50 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RFX8Q6ZV50 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RFX8Q6ZV50 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RFX8Q6ZV50 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RFX8Q6ZV50 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RFX8Q6ZV50 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RFX8Q6ZV50 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RFX8Q6ZV50 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RFX8Q6ZV50 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFX8Q6ZV50 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFX8Q6ZV50 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFX8Q6ZV50 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFX8Q6ZV50 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFX8Q6ZV50 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFX8Q6ZV50 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFX8Q6ZV50 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFX8Q6ZV50 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFX8Q6ZV50 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFX8Q6ZV50 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFX8Q6ZV50 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFX8Q6ZV50 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFX8Q6ZV50 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFX8Q6ZV50 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFX8Q6ZV50 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFX8Q6ZV50 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RFX8Q6ZV50 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RFX8Q6ZV50 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RFX8Q6ZV50 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RFX8Q6ZV50 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RFX8Q6ZV50 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RFX8Q6ZV50 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RFX8Q6ZV50 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RFX8Q6ZV50 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.1 ms