Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CASC2Q6XLA1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CASC2Q6XLA1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CASC2Q6XLA1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CASC2Q6XLA1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CASC2Q6XLA1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CASC2Q6XLA1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CASC2Q6XLA1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CASC2Q6XLA1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CASC2Q6XLA1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CASC2Q6XLA1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CASC2Q6XLA1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CASC2Q6XLA1 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CASC2Q6XLA1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CASC2Q6XLA1 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CASC2Q6XLA1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CASC2Q6XLA1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CASC2Q6XLA1 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CASC2Q6XLA1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CASC2Q6XLA1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CASC2Q6XLA1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CASC2Q6XLA1 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CASC2Q6XLA1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CASC2Q6XLA1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CASC2Q6XLA1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CASC2Q6XLA1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CASC2Q6XLA1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CASC2Q6XLA1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CASC2Q6XLA1 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CASC2Q6XLA1 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CASC2Q6XLA1 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CASC2Q6XLA1 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CASC2Q6XLA1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CASC2Q6XLA1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CASC2Q6XLA1 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CASC2Q6XLA1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CASC2Q6XLA1 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CASC2Q6XLA1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CASC2Q6XLA1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CASC2Q6XLA1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CASC2Q6XLA1 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CASC2Q6XLA1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CASC2Q6XLA1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CASC2Q6XLA1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CASC2Q6XLA1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CASC2Q6XLA1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CASC2Q6XLA1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CASC2Q6XLA1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CASC2Q6XLA1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CASC2Q6XLA1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CASC2Q6XLA1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CASC2Q6XLA1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CASC2Q6XLA1 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CASC2Q6XLA1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CASC2Q6XLA1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CASC2Q6XLA1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CASC2Q6XLA1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CASC2Q6XLA1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CASC2Q6XLA1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CASC2Q6XLA1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CASC2Q6XLA1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CASC2Q6XLA1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CASC2Q6XLA1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CASC2Q6XLA1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CASC2Q6XLA1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CASC2Q6XLA1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CASC2Q6XLA1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CASC2Q6XLA1 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CASC2Q6XLA1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CASC2Q6XLA1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CASC2Q6XLA1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CASC2Q6XLA1 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CASC2Q6XLA1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CASC2Q6XLA1 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CASC2Q6XLA1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CASC2Q6XLA1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CASC2Q6XLA1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CASC2Q6XLA1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CASC2Q6XLA1 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CASC2Q6XLA1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CASC2Q6XLA1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CASC2Q6XLA1 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CASC2Q6XLA1 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CASC2Q6XLA1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CASC2Q6XLA1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CASC2Q6XLA1 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CASC2Q6XLA1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CASC2Q6XLA1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CASC2Q6XLA1 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CASC2Q6XLA1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CASC2Q6XLA1 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CASC2Q6XLA1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CASC2Q6XLA1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CASC2Q6XLA1 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CASC2Q6XLA1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CASC2Q6XLA1 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CASC2Q6XLA1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CASC2Q6XLA1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CASC2Q6XLA1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CASC2Q6XLA1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms