Protein–RNA interactions for Protein: Q6VVB1

NHLRC1, E3 ubiquitin-protein ligase NHLRC1, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC1Q6VVB1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NHLRC1Q6VVB1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NHLRC1Q6VVB1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NHLRC1Q6VVB1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NHLRC1Q6VVB1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NHLRC1Q6VVB1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NHLRC1Q6VVB1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NHLRC1Q6VVB1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NHLRC1Q6VVB1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NHLRC1Q6VVB1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NHLRC1Q6VVB1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NHLRC1Q6VVB1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NHLRC1Q6VVB1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NHLRC1Q6VVB1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NHLRC1Q6VVB1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NHLRC1Q6VVB1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NHLRC1Q6VVB1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NHLRC1Q6VVB1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NHLRC1Q6VVB1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NHLRC1Q6VVB1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NHLRC1Q6VVB1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NHLRC1Q6VVB1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NHLRC1Q6VVB1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NHLRC1Q6VVB1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NHLRC1Q6VVB1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NHLRC1Q6VVB1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NHLRC1Q6VVB1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NHLRC1Q6VVB1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NHLRC1Q6VVB1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NHLRC1Q6VVB1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NHLRC1Q6VVB1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NHLRC1Q6VVB1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NHLRC1Q6VVB1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NHLRC1Q6VVB1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NHLRC1Q6VVB1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NHLRC1Q6VVB1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NHLRC1Q6VVB1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NHLRC1Q6VVB1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NHLRC1Q6VVB1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NHLRC1Q6VVB1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NHLRC1Q6VVB1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NHLRC1Q6VVB1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NHLRC1Q6VVB1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NHLRC1Q6VVB1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NHLRC1Q6VVB1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NHLRC1Q6VVB1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NHLRC1Q6VVB1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NHLRC1Q6VVB1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NHLRC1Q6VVB1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NHLRC1Q6VVB1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NHLRC1Q6VVB1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NHLRC1Q6VVB1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NHLRC1Q6VVB1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NHLRC1Q6VVB1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NHLRC1Q6VVB1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NHLRC1Q6VVB1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NHLRC1Q6VVB1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NHLRC1Q6VVB1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NHLRC1Q6VVB1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NHLRC1Q6VVB1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NHLRC1Q6VVB1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NHLRC1Q6VVB1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NHLRC1Q6VVB1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NHLRC1Q6VVB1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NHLRC1Q6VVB1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NHLRC1Q6VVB1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NHLRC1Q6VVB1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NHLRC1Q6VVB1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NHLRC1Q6VVB1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NHLRC1Q6VVB1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NHLRC1Q6VVB1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NHLRC1Q6VVB1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NHLRC1Q6VVB1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NHLRC1Q6VVB1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NHLRC1Q6VVB1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NHLRC1Q6VVB1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NHLRC1Q6VVB1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NHLRC1Q6VVB1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NHLRC1Q6VVB1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NHLRC1Q6VVB1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NHLRC1Q6VVB1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NHLRC1Q6VVB1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NHLRC1Q6VVB1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NHLRC1Q6VVB1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NHLRC1Q6VVB1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NHLRC1Q6VVB1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NHLRC1Q6VVB1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NHLRC1Q6VVB1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NHLRC1Q6VVB1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NHLRC1Q6VVB1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NHLRC1Q6VVB1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NHLRC1Q6VVB1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NHLRC1Q6VVB1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NHLRC1Q6VVB1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NHLRC1Q6VVB1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NHLRC1Q6VVB1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NHLRC1Q6VVB1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NHLRC1Q6VVB1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NHLRC1Q6VVB1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NHLRC1Q6VVB1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms