Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atp8b3Q6UQ17 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atp8b3Q6UQ17 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atp8b3Q6UQ17 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atp8b3Q6UQ17 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atp8b3Q6UQ17 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atp8b3Q6UQ17 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atp8b3Q6UQ17 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atp8b3Q6UQ17 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atp8b3Q6UQ17 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atp8b3Q6UQ17 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Atp8b3Q6UQ17 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atp8b3Q6UQ17 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atp8b3Q6UQ17 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atp8b3Q6UQ17 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atp8b3Q6UQ17 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atp8b3Q6UQ17 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atp8b3Q6UQ17 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atp8b3Q6UQ17 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atp8b3Q6UQ17 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atp8b3Q6UQ17 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atp8b3Q6UQ17 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atp8b3Q6UQ17 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atp8b3Q6UQ17 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atp8b3Q6UQ17 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atp8b3Q6UQ17 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atp8b3Q6UQ17 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp8b3Q6UQ17 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp8b3Q6UQ17 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp8b3Q6UQ17 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp8b3Q6UQ17 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp8b3Q6UQ17 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp8b3Q6UQ17 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp8b3Q6UQ17 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atp8b3Q6UQ17 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atp8b3Q6UQ17 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Atp8b3Q6UQ17 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Atp8b3Q6UQ17 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atp8b3Q6UQ17 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atp8b3Q6UQ17 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atp8b3Q6UQ17 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atp8b3Q6UQ17 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Atp8b3Q6UQ17 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atp8b3Q6UQ17 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atp8b3Q6UQ17 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atp8b3Q6UQ17 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atp8b3Q6UQ17 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Atp8b3Q6UQ17 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Atp8b3Q6UQ17 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Atp8b3Q6UQ17 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atp8b3Q6UQ17 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atp8b3Q6UQ17 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atp8b3Q6UQ17 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atp8b3Q6UQ17 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atp8b3Q6UQ17 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atp8b3Q6UQ17 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Atp8b3Q6UQ17 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atp8b3Q6UQ17 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atp8b3Q6UQ17 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atp8b3Q6UQ17 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atp8b3Q6UQ17 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atp8b3Q6UQ17 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atp8b3Q6UQ17 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atp8b3Q6UQ17 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atp8b3Q6UQ17 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atp8b3Q6UQ17 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp8b3Q6UQ17 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp8b3Q6UQ17 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp8b3Q6UQ17 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp8b3Q6UQ17 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp8b3Q6UQ17 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp8b3Q6UQ17 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp8b3Q6UQ17 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp8b3Q6UQ17 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Atp8b3Q6UQ17 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Atp8b3Q6UQ17 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Atp8b3Q6UQ17 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Atp8b3Q6UQ17 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atp8b3Q6UQ17 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atp8b3Q6UQ17 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Atp8b3Q6UQ17 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp8b3Q6UQ17 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp8b3Q6UQ17 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp8b3Q6UQ17 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp8b3Q6UQ17 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp8b3Q6UQ17 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp8b3Q6UQ17 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp8b3Q6UQ17 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp8b3Q6UQ17 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp8b3Q6UQ17 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp8b3Q6UQ17 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp8b3Q6UQ17 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atp8b3Q6UQ17 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atp8b3Q6UQ17 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atp8b3Q6UQ17 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atp8b3Q6UQ17 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atp8b3Q6UQ17 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp8b3Q6UQ17 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp8b3Q6UQ17 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp8b3Q6UQ17 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms