Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU8

Casc1, Protein CASC1, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc1Q6TDU8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Casc1Q6TDU8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Casc1Q6TDU8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Casc1Q6TDU8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Casc1Q6TDU8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Casc1Q6TDU8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Casc1Q6TDU8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Casc1Q6TDU8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Casc1Q6TDU8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Casc1Q6TDU8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Casc1Q6TDU8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Casc1Q6TDU8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Casc1Q6TDU8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Casc1Q6TDU8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Casc1Q6TDU8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Casc1Q6TDU8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Casc1Q6TDU8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Casc1Q6TDU8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Casc1Q6TDU8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Casc1Q6TDU8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Casc1Q6TDU8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Casc1Q6TDU8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Casc1Q6TDU8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Casc1Q6TDU8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Casc1Q6TDU8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Casc1Q6TDU8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Casc1Q6TDU8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Casc1Q6TDU8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Casc1Q6TDU8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Casc1Q6TDU8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Casc1Q6TDU8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Casc1Q6TDU8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Casc1Q6TDU8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Casc1Q6TDU8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Casc1Q6TDU8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Casc1Q6TDU8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Casc1Q6TDU8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Casc1Q6TDU8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Casc1Q6TDU8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Casc1Q6TDU8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Casc1Q6TDU8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Casc1Q6TDU8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Casc1Q6TDU8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Casc1Q6TDU8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Casc1Q6TDU8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Casc1Q6TDU8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Casc1Q6TDU8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Casc1Q6TDU8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Casc1Q6TDU8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Casc1Q6TDU8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Casc1Q6TDU8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Casc1Q6TDU8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Casc1Q6TDU8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Casc1Q6TDU8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Casc1Q6TDU8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Casc1Q6TDU8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Casc1Q6TDU8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Casc1Q6TDU8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Casc1Q6TDU8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Casc1Q6TDU8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Casc1Q6TDU8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Casc1Q6TDU8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Casc1Q6TDU8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Casc1Q6TDU8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Casc1Q6TDU8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Casc1Q6TDU8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Casc1Q6TDU8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Casc1Q6TDU8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Casc1Q6TDU8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Casc1Q6TDU8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Casc1Q6TDU8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Casc1Q6TDU8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Casc1Q6TDU8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Casc1Q6TDU8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Casc1Q6TDU8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Casc1Q6TDU8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Casc1Q6TDU8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Casc1Q6TDU8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Casc1Q6TDU8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Casc1Q6TDU8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Casc1Q6TDU8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Casc1Q6TDU8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Casc1Q6TDU8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Casc1Q6TDU8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Casc1Q6TDU8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Casc1Q6TDU8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Casc1Q6TDU8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Casc1Q6TDU8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Casc1Q6TDU8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Casc1Q6TDU8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Casc1Q6TDU8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Casc1Q6TDU8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Casc1Q6TDU8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Casc1Q6TDU8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Casc1Q6TDU8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Casc1Q6TDU8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Casc1Q6TDU8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Casc1Q6TDU8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Casc1Q6TDU8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Casc1Q6TDU8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.9 ms