Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF3

Med16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med16Q6PGF3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Med16Q6PGF3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Med16Q6PGF3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Med16Q6PGF3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Med16Q6PGF3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Med16Q6PGF3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Med16Q6PGF3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Med16Q6PGF3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Med16Q6PGF3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Med16Q6PGF3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Med16Q6PGF3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Med16Q6PGF3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Med16Q6PGF3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Med16Q6PGF3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Med16Q6PGF3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Med16Q6PGF3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Med16Q6PGF3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Med16Q6PGF3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Med16Q6PGF3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Med16Q6PGF3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Med16Q6PGF3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Med16Q6PGF3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Med16Q6PGF3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Med16Q6PGF3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Med16Q6PGF3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Med16Q6PGF3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Med16Q6PGF3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Med16Q6PGF3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Med16Q6PGF3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Med16Q6PGF3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Med16Q6PGF3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Med16Q6PGF3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Med16Q6PGF3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Med16Q6PGF3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Med16Q6PGF3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Med16Q6PGF3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Med16Q6PGF3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Med16Q6PGF3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Med16Q6PGF3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Med16Q6PGF3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Med16Q6PGF3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Med16Q6PGF3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Med16Q6PGF3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Med16Q6PGF3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Med16Q6PGF3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Med16Q6PGF3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Med16Q6PGF3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Med16Q6PGF3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Med16Q6PGF3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Med16Q6PGF3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Med16Q6PGF3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Med16Q6PGF3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Med16Q6PGF3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Med16Q6PGF3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Med16Q6PGF3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Med16Q6PGF3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Med16Q6PGF3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Med16Q6PGF3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Med16Q6PGF3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Med16Q6PGF3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Med16Q6PGF3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Med16Q6PGF3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Med16Q6PGF3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Med16Q6PGF3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Med16Q6PGF3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Med16Q6PGF3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Med16Q6PGF3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Med16Q6PGF3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Med16Q6PGF3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Med16Q6PGF3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Med16Q6PGF3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Med16Q6PGF3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Med16Q6PGF3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Med16Q6PGF3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Med16Q6PGF3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Med16Q6PGF3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Med16Q6PGF3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Med16Q6PGF3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Med16Q6PGF3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Med16Q6PGF3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Med16Q6PGF3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Med16Q6PGF3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Med16Q6PGF3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Med16Q6PGF3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Med16Q6PGF3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Med16Q6PGF3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Med16Q6PGF3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Med16Q6PGF3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Med16Q6PGF3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Med16Q6PGF3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Med16Q6PGF3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Med16Q6PGF3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Med16Q6PGF3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Med16Q6PGF3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Med16Q6PGF3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Med16Q6PGF3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Med16Q6PGF3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Med16Q6PGF3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Med16Q6PGF3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Med16Q6PGF3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms