Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDZ2

Taf1c, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1cQ6PDZ2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Taf1cQ6PDZ2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Taf1cQ6PDZ2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Taf1cQ6PDZ2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Taf1cQ6PDZ2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Taf1cQ6PDZ2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Taf1cQ6PDZ2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Taf1cQ6PDZ2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Taf1cQ6PDZ2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Taf1cQ6PDZ2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Taf1cQ6PDZ2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Taf1cQ6PDZ2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Taf1cQ6PDZ2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Taf1cQ6PDZ2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Taf1cQ6PDZ2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Taf1cQ6PDZ2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Taf1cQ6PDZ2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Taf1cQ6PDZ2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Taf1cQ6PDZ2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Taf1cQ6PDZ2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Taf1cQ6PDZ2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Taf1cQ6PDZ2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Taf1cQ6PDZ2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Taf1cQ6PDZ2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Taf1cQ6PDZ2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Taf1cQ6PDZ2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Taf1cQ6PDZ2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Taf1cQ6PDZ2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Taf1cQ6PDZ2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Taf1cQ6PDZ2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Taf1cQ6PDZ2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Taf1cQ6PDZ2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Taf1cQ6PDZ2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Taf1cQ6PDZ2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Taf1cQ6PDZ2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Taf1cQ6PDZ2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Taf1cQ6PDZ2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Taf1cQ6PDZ2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Taf1cQ6PDZ2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Taf1cQ6PDZ2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Taf1cQ6PDZ2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Taf1cQ6PDZ2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Taf1cQ6PDZ2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Taf1cQ6PDZ2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Taf1cQ6PDZ2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Taf1cQ6PDZ2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Taf1cQ6PDZ2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Taf1cQ6PDZ2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Taf1cQ6PDZ2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Taf1cQ6PDZ2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Taf1cQ6PDZ2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Taf1cQ6PDZ2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Taf1cQ6PDZ2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Taf1cQ6PDZ2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Taf1cQ6PDZ2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Taf1cQ6PDZ2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Taf1cQ6PDZ2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Taf1cQ6PDZ2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Taf1cQ6PDZ2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Taf1cQ6PDZ2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Taf1cQ6PDZ2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Taf1cQ6PDZ2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Taf1cQ6PDZ2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Taf1cQ6PDZ2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Taf1cQ6PDZ2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Taf1cQ6PDZ2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Taf1cQ6PDZ2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Taf1cQ6PDZ2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Taf1cQ6PDZ2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Taf1cQ6PDZ2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Taf1cQ6PDZ2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Taf1cQ6PDZ2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Taf1cQ6PDZ2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Taf1cQ6PDZ2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Taf1cQ6PDZ2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Taf1cQ6PDZ2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Taf1cQ6PDZ2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Taf1cQ6PDZ2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Taf1cQ6PDZ2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Taf1cQ6PDZ2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Taf1cQ6PDZ2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Taf1cQ6PDZ2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Taf1cQ6PDZ2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Taf1cQ6PDZ2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Taf1cQ6PDZ2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Taf1cQ6PDZ2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Taf1cQ6PDZ2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Taf1cQ6PDZ2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Taf1cQ6PDZ2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Taf1cQ6PDZ2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Taf1cQ6PDZ2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Taf1cQ6PDZ2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Taf1cQ6PDZ2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Taf1cQ6PDZ2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Taf1cQ6PDZ2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Taf1cQ6PDZ2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Taf1cQ6PDZ2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Taf1cQ6PDZ2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Taf1cQ6PDZ2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Taf1cQ6PDZ2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82 ms