Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9P0

Slf2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slf2Q6P9P0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Slf2Q6P9P0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Slf2Q6P9P0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Slf2Q6P9P0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Slf2Q6P9P0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Slf2Q6P9P0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Slf2Q6P9P0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Slf2Q6P9P0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Slf2Q6P9P0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Slf2Q6P9P0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Slf2Q6P9P0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Slf2Q6P9P0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Slf2Q6P9P0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Slf2Q6P9P0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Slf2Q6P9P0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Slf2Q6P9P0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Slf2Q6P9P0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Slf2Q6P9P0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Slf2Q6P9P0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Slf2Q6P9P0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Slf2Q6P9P0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Slf2Q6P9P0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Slf2Q6P9P0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Slf2Q6P9P0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Slf2Q6P9P0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Slf2Q6P9P0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Slf2Q6P9P0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Slf2Q6P9P0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Slf2Q6P9P0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Slf2Q6P9P0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Slf2Q6P9P0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Slf2Q6P9P0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Slf2Q6P9P0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Slf2Q6P9P0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Slf2Q6P9P0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Slf2Q6P9P0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Slf2Q6P9P0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Slf2Q6P9P0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Slf2Q6P9P0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Slf2Q6P9P0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Slf2Q6P9P0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Slf2Q6P9P0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Slf2Q6P9P0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Slf2Q6P9P0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Slf2Q6P9P0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Slf2Q6P9P0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Slf2Q6P9P0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Slf2Q6P9P0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Slf2Q6P9P0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Slf2Q6P9P0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Slf2Q6P9P0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Slf2Q6P9P0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Slf2Q6P9P0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Slf2Q6P9P0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Slf2Q6P9P0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Slf2Q6P9P0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Slf2Q6P9P0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Slf2Q6P9P0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Slf2Q6P9P0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Slf2Q6P9P0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Slf2Q6P9P0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Slf2Q6P9P0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Slf2Q6P9P0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Slf2Q6P9P0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Slf2Q6P9P0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Slf2Q6P9P0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Slf2Q6P9P0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Slf2Q6P9P0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Slf2Q6P9P0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Slf2Q6P9P0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Slf2Q6P9P0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Slf2Q6P9P0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Slf2Q6P9P0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Slf2Q6P9P0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Slf2Q6P9P0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Slf2Q6P9P0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Slf2Q6P9P0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Slf2Q6P9P0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Slf2Q6P9P0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Slf2Q6P9P0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Slf2Q6P9P0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Slf2Q6P9P0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Slf2Q6P9P0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Slf2Q6P9P0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Slf2Q6P9P0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Slf2Q6P9P0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Slf2Q6P9P0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Slf2Q6P9P0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Slf2Q6P9P0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Slf2Q6P9P0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Slf2Q6P9P0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Slf2Q6P9P0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Slf2Q6P9P0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Slf2Q6P9P0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Slf2Q6P9P0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Slf2Q6P9P0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Slf2Q6P9P0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Slf2Q6P9P0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Slf2Q6P9P0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Slf2Q6P9P0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms