Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3X3

TTC27, Tetratricopeptide repeat protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC27Q6P3X3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTC27Q6P3X3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTC27Q6P3X3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTC27Q6P3X3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC27Q6P3X3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC27Q6P3X3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC27Q6P3X3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC27Q6P3X3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC27Q6P3X3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC27Q6P3X3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC27Q6P3X3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC27Q6P3X3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC27Q6P3X3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC27Q6P3X3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC27Q6P3X3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC27Q6P3X3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC27Q6P3X3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC27Q6P3X3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC27Q6P3X3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC27Q6P3X3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC27Q6P3X3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC27Q6P3X3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC27Q6P3X3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC27Q6P3X3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTC27Q6P3X3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTC27Q6P3X3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TTC27Q6P3X3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTC27Q6P3X3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TTC27Q6P3X3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTC27Q6P3X3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTC27Q6P3X3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TTC27Q6P3X3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTC27Q6P3X3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTC27Q6P3X3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTC27Q6P3X3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTC27Q6P3X3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTC27Q6P3X3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTC27Q6P3X3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTC27Q6P3X3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTC27Q6P3X3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TTC27Q6P3X3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TTC27Q6P3X3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TTC27Q6P3X3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TTC27Q6P3X3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TTC27Q6P3X3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TTC27Q6P3X3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TTC27Q6P3X3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TTC27Q6P3X3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TTC27Q6P3X3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TTC27Q6P3X3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TTC27Q6P3X3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTC27Q6P3X3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTC27Q6P3X3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTC27Q6P3X3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTC27Q6P3X3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTC27Q6P3X3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC27Q6P3X3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC27Q6P3X3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC27Q6P3X3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC27Q6P3X3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC27Q6P3X3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC27Q6P3X3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC27Q6P3X3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC27Q6P3X3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTC27Q6P3X3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTC27Q6P3X3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTC27Q6P3X3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTC27Q6P3X3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTC27Q6P3X3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTC27Q6P3X3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTC27Q6P3X3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTC27Q6P3X3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTC27Q6P3X3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTC27Q6P3X3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTC27Q6P3X3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTC27Q6P3X3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTC27Q6P3X3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTC27Q6P3X3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTC27Q6P3X3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTC27Q6P3X3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC27Q6P3X3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC27Q6P3X3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC27Q6P3X3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC27Q6P3X3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC27Q6P3X3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC27Q6P3X3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC27Q6P3X3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC27Q6P3X3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC27Q6P3X3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC27Q6P3X3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC27Q6P3X3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC27Q6P3X3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTC27Q6P3X3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TTC27Q6P3X3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC27Q6P3X3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC27Q6P3X3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC27Q6P3X3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC27Q6P3X3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC27Q6P3X3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC27Q6P3X3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms