Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1K2

PMF1, Polyamine-modulated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMF1Q6P1K2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PMF1Q6P1K2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PMF1Q6P1K2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PMF1Q6P1K2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PMF1Q6P1K2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PMF1Q6P1K2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PMF1Q6P1K2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PMF1Q6P1K2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PMF1Q6P1K2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PMF1Q6P1K2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PMF1Q6P1K2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PMF1Q6P1K2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PMF1Q6P1K2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PMF1Q6P1K2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PMF1Q6P1K2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PMF1Q6P1K2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PMF1Q6P1K2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PMF1Q6P1K2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PMF1Q6P1K2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PMF1Q6P1K2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PMF1Q6P1K2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PMF1Q6P1K2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PMF1Q6P1K2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PMF1Q6P1K2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PMF1Q6P1K2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PMF1Q6P1K2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PMF1Q6P1K2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PMF1Q6P1K2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PMF1Q6P1K2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PMF1Q6P1K2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PMF1Q6P1K2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PMF1Q6P1K2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PMF1Q6P1K2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PMF1Q6P1K2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PMF1Q6P1K2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PMF1Q6P1K2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PMF1Q6P1K2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PMF1Q6P1K2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PMF1Q6P1K2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PMF1Q6P1K2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PMF1Q6P1K2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PMF1Q6P1K2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PMF1Q6P1K2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PMF1Q6P1K2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PMF1Q6P1K2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PMF1Q6P1K2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PMF1Q6P1K2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PMF1Q6P1K2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PMF1Q6P1K2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PMF1Q6P1K2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PMF1Q6P1K2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PMF1Q6P1K2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PMF1Q6P1K2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PMF1Q6P1K2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PMF1Q6P1K2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PMF1Q6P1K2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PMF1Q6P1K2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PMF1Q6P1K2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PMF1Q6P1K2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PMF1Q6P1K2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PMF1Q6P1K2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PMF1Q6P1K2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PMF1Q6P1K2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PMF1Q6P1K2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PMF1Q6P1K2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PMF1Q6P1K2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PMF1Q6P1K2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PMF1Q6P1K2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PMF1Q6P1K2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PMF1Q6P1K2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PMF1Q6P1K2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PMF1Q6P1K2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PMF1Q6P1K2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PMF1Q6P1K2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PMF1Q6P1K2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PMF1Q6P1K2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PMF1Q6P1K2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PMF1Q6P1K2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PMF1Q6P1K2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PMF1Q6P1K2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PMF1Q6P1K2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PMF1Q6P1K2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PMF1Q6P1K2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PMF1Q6P1K2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PMF1Q6P1K2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PMF1Q6P1K2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PMF1Q6P1K2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PMF1Q6P1K2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PMF1Q6P1K2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PMF1Q6P1K2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PMF1Q6P1K2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PMF1Q6P1K2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PMF1Q6P1K2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PMF1Q6P1K2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PMF1Q6P1K2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PMF1Q6P1K2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PMF1Q6P1K2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PMF1Q6P1K2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PMF1Q6P1K2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PMF1Q6P1K2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms