Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC33.81■■■■□ 3
Slx4Q6P1D7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Slx4Q6P1D7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Slx4Q6P1D7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Slx4Q6P1D7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
Slx4Q6P1D7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Slx4Q6P1D7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Slx4Q6P1D7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Slx4Q6P1D7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Slx4Q6P1D7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
Slx4Q6P1D7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Slx4Q6P1D7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Slx4Q6P1D7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Slx4Q6P1D7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Slx4Q6P1D7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Slx4Q6P1D7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Slx4Q6P1D7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC33.77■■■■□ 3
Slx4Q6P1D7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Slx4Q6P1D7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
Slx4Q6P1D7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC33.77■■■■□ 3
Slx4Q6P1D7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC33.77■■■■□ 3
Slx4Q6P1D7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Slx4Q6P1D7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Slx4Q6P1D7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Slx4Q6P1D7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Slx4Q6P1D7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Slx4Q6P1D7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Slx4Q6P1D7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
Slx4Q6P1D7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Slx4Q6P1D7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Slx4Q6P1D7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Slx4Q6P1D7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Slx4Q6P1D7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Slx4Q6P1D7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Slx4Q6P1D7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Slx4Q6P1D7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
Slx4Q6P1D7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Slx4Q6P1D7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Slx4Q6P1D7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Slx4Q6P1D7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Slx4Q6P1D7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Slx4Q6P1D7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Slx4Q6P1D7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
Slx4Q6P1D7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Slx4Q6P1D7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Slx4Q6P1D7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Slx4Q6P1D7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Slx4Q6P1D7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.98
Slx4Q6P1D7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Slx4Q6P1D7 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Slx4Q6P1D7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Slx4Q6P1D7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Slx4Q6P1D7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Slx4Q6P1D7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Slx4Q6P1D7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Slx4Q6P1D7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
Slx4Q6P1D7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Slx4Q6P1D7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Slx4Q6P1D7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Slx4Q6P1D7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Slx4Q6P1D7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Slx4Q6P1D7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Slx4Q6P1D7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Slx4Q6P1D7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Slx4Q6P1D7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Slx4Q6P1D7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Slx4Q6P1D7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Slx4Q6P1D7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Slx4Q6P1D7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Slx4Q6P1D7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Slx4Q6P1D7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Slx4Q6P1D7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Slx4Q6P1D7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
Slx4Q6P1D7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Slx4Q6P1D7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Slx4Q6P1D7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Slx4Q6P1D7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Slx4Q6P1D7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Slx4Q6P1D7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Slx4Q6P1D7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Slx4Q6P1D7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Slx4Q6P1D7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Slx4Q6P1D7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Slx4Q6P1D7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Slx4Q6P1D7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Slx4Q6P1D7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Slx4Q6P1D7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Slx4Q6P1D7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Slx4Q6P1D7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Slx4Q6P1D7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
Slx4Q6P1D7 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
Slx4Q6P1D7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Slx4Q6P1D7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Slx4Q6P1D7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Slx4Q6P1D7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Slx4Q6P1D7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Slx4Q6P1D7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Slx4Q6P1D7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
Slx4Q6P1D7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Slx4Q6P1D7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms