Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXN1

Szrd1, SUZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Szrd1Q6NXN1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Szrd1Q6NXN1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Szrd1Q6NXN1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Szrd1Q6NXN1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Szrd1Q6NXN1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Szrd1Q6NXN1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Szrd1Q6NXN1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Szrd1Q6NXN1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Szrd1Q6NXN1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Szrd1Q6NXN1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Szrd1Q6NXN1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Szrd1Q6NXN1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Szrd1Q6NXN1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Szrd1Q6NXN1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Szrd1Q6NXN1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Szrd1Q6NXN1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Szrd1Q6NXN1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Szrd1Q6NXN1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Szrd1Q6NXN1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Szrd1Q6NXN1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Szrd1Q6NXN1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Szrd1Q6NXN1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Szrd1Q6NXN1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Szrd1Q6NXN1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Szrd1Q6NXN1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Szrd1Q6NXN1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Szrd1Q6NXN1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Szrd1Q6NXN1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Szrd1Q6NXN1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Szrd1Q6NXN1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Szrd1Q6NXN1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Szrd1Q6NXN1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Szrd1Q6NXN1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Szrd1Q6NXN1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Szrd1Q6NXN1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Szrd1Q6NXN1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Szrd1Q6NXN1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Szrd1Q6NXN1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Szrd1Q6NXN1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Szrd1Q6NXN1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Szrd1Q6NXN1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Szrd1Q6NXN1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Szrd1Q6NXN1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Szrd1Q6NXN1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Szrd1Q6NXN1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Szrd1Q6NXN1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Szrd1Q6NXN1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Szrd1Q6NXN1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Szrd1Q6NXN1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Szrd1Q6NXN1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Szrd1Q6NXN1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Szrd1Q6NXN1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Szrd1Q6NXN1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Szrd1Q6NXN1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Szrd1Q6NXN1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Szrd1Q6NXN1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Szrd1Q6NXN1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Szrd1Q6NXN1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Szrd1Q6NXN1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Szrd1Q6NXN1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Szrd1Q6NXN1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Szrd1Q6NXN1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Szrd1Q6NXN1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Szrd1Q6NXN1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Szrd1Q6NXN1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Szrd1Q6NXN1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Szrd1Q6NXN1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Szrd1Q6NXN1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Szrd1Q6NXN1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Szrd1Q6NXN1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Szrd1Q6NXN1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Szrd1Q6NXN1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Szrd1Q6NXN1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Szrd1Q6NXN1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Szrd1Q6NXN1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Szrd1Q6NXN1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Szrd1Q6NXN1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Szrd1Q6NXN1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Szrd1Q6NXN1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Szrd1Q6NXN1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Szrd1Q6NXN1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Szrd1Q6NXN1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Szrd1Q6NXN1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Szrd1Q6NXN1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Szrd1Q6NXN1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Szrd1Q6NXN1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Szrd1Q6NXN1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Szrd1Q6NXN1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Szrd1Q6NXN1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Szrd1Q6NXN1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Szrd1Q6NXN1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Szrd1Q6NXN1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Szrd1Q6NXN1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Szrd1Q6NXN1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Szrd1Q6NXN1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Szrd1Q6NXN1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Szrd1Q6NXN1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Szrd1Q6NXN1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Szrd1Q6NXN1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Szrd1Q6NXN1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 219.5 ms