Protein–RNA interactions for Protein: Q6NV83

U2surp, U2 snRNP-associated SURP motif-containing protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2surpQ6NV83 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
U2surpQ6NV83 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
U2surpQ6NV83 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
U2surpQ6NV83 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
U2surpQ6NV83 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
U2surpQ6NV83 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
U2surpQ6NV83 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
U2surpQ6NV83 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
U2surpQ6NV83 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
U2surpQ6NV83 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
U2surpQ6NV83 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
U2surpQ6NV83 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
U2surpQ6NV83 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
U2surpQ6NV83 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
U2surpQ6NV83 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
U2surpQ6NV83 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
U2surpQ6NV83 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
U2surpQ6NV83 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
U2surpQ6NV83 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
U2surpQ6NV83 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
U2surpQ6NV83 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
U2surpQ6NV83 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
U2surpQ6NV83 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
U2surpQ6NV83 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
U2surpQ6NV83 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
U2surpQ6NV83 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
U2surpQ6NV83 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
U2surpQ6NV83 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
U2surpQ6NV83 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
U2surpQ6NV83 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
U2surpQ6NV83 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
U2surpQ6NV83 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
U2surpQ6NV83 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
U2surpQ6NV83 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
U2surpQ6NV83 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
U2surpQ6NV83 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
U2surpQ6NV83 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
U2surpQ6NV83 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
U2surpQ6NV83 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
U2surpQ6NV83 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
U2surpQ6NV83 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
U2surpQ6NV83 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
U2surpQ6NV83 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
U2surpQ6NV83 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
U2surpQ6NV83 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
U2surpQ6NV83 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
U2surpQ6NV83 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
U2surpQ6NV83 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
U2surpQ6NV83 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
U2surpQ6NV83 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
U2surpQ6NV83 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
U2surpQ6NV83 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
U2surpQ6NV83 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
U2surpQ6NV83 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
U2surpQ6NV83 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
U2surpQ6NV83 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
U2surpQ6NV83 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
U2surpQ6NV83 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
U2surpQ6NV83 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
U2surpQ6NV83 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
U2surpQ6NV83 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
U2surpQ6NV83 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
U2surpQ6NV83 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
U2surpQ6NV83 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
U2surpQ6NV83 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
U2surpQ6NV83 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
U2surpQ6NV83 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
U2surpQ6NV83 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
U2surpQ6NV83 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
U2surpQ6NV83 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
U2surpQ6NV83 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
U2surpQ6NV83 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
U2surpQ6NV83 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
U2surpQ6NV83 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
U2surpQ6NV83 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
U2surpQ6NV83 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
U2surpQ6NV83 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
U2surpQ6NV83 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
U2surpQ6NV83 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
U2surpQ6NV83 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
U2surpQ6NV83 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
U2surpQ6NV83 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
U2surpQ6NV83 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
U2surpQ6NV83 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
U2surpQ6NV83 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
U2surpQ6NV83 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
U2surpQ6NV83 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
U2surpQ6NV83 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
U2surpQ6NV83 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
U2surpQ6NV83 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
U2surpQ6NV83 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
U2surpQ6NV83 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
U2surpQ6NV83 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
U2surpQ6NV83 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
U2surpQ6NV83 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
U2surpQ6NV83 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
U2surpQ6NV83 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
U2surpQ6NV83 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
U2surpQ6NV83 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
U2surpQ6NV83 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms