Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU8

Atg16l2, Autophagy-related protein 16-2, mousemouse

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l2Q6KAU8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atg16l2Q6KAU8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atg16l2Q6KAU8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atg16l2Q6KAU8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atg16l2Q6KAU8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atg16l2Q6KAU8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Atg16l2Q6KAU8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg16l2Q6KAU8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg16l2Q6KAU8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg16l2Q6KAU8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg16l2Q6KAU8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg16l2Q6KAU8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg16l2Q6KAU8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg16l2Q6KAU8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg16l2Q6KAU8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg16l2Q6KAU8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg16l2Q6KAU8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg16l2Q6KAU8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atg16l2Q6KAU8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atg16l2Q6KAU8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atg16l2Q6KAU8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Atg16l2Q6KAU8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atg16l2Q6KAU8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atg16l2Q6KAU8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atg16l2Q6KAU8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atg16l2Q6KAU8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg16l2Q6KAU8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg16l2Q6KAU8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg16l2Q6KAU8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg16l2Q6KAU8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg16l2Q6KAU8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg16l2Q6KAU8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg16l2Q6KAU8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg16l2Q6KAU8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg16l2Q6KAU8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg16l2Q6KAU8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg16l2Q6KAU8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg16l2Q6KAU8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg16l2Q6KAU8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atg16l2Q6KAU8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atg16l2Q6KAU8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atg16l2Q6KAU8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atg16l2Q6KAU8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atg16l2Q6KAU8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atg16l2Q6KAU8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Atg16l2Q6KAU8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Atg16l2Q6KAU8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atg16l2Q6KAU8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atg16l2Q6KAU8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atg16l2Q6KAU8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atg16l2Q6KAU8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atg16l2Q6KAU8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atg16l2Q6KAU8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atg16l2Q6KAU8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atg16l2Q6KAU8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atg16l2Q6KAU8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atg16l2Q6KAU8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atg16l2Q6KAU8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atg16l2Q6KAU8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atg16l2Q6KAU8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atg16l2Q6KAU8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atg16l2Q6KAU8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atg16l2Q6KAU8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atg16l2Q6KAU8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atg16l2Q6KAU8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg16l2Q6KAU8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg16l2Q6KAU8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg16l2Q6KAU8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg16l2Q6KAU8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg16l2Q6KAU8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg16l2Q6KAU8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg16l2Q6KAU8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg16l2Q6KAU8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg16l2Q6KAU8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg16l2Q6KAU8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg16l2Q6KAU8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg16l2Q6KAU8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg16l2Q6KAU8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg16l2Q6KAU8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg16l2Q6KAU8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg16l2Q6KAU8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atg16l2Q6KAU8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atg16l2Q6KAU8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atg16l2Q6KAU8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atg16l2Q6KAU8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atg16l2Q6KAU8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atg16l2Q6KAU8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atg16l2Q6KAU8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atg16l2Q6KAU8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg16l2Q6KAU8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg16l2Q6KAU8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg16l2Q6KAU8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg16l2Q6KAU8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg16l2Q6KAU8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg16l2Q6KAU8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atg16l2Q6KAU8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atg16l2Q6KAU8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atg16l2Q6KAU8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atg16l2Q6KAU8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atg16l2Q6KAU8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms