Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVE9

LCN8, Epididymal-specific lipocalin-8, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN8Q6JVE9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LCN8Q6JVE9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LCN8Q6JVE9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LCN8Q6JVE9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LCN8Q6JVE9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LCN8Q6JVE9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LCN8Q6JVE9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LCN8Q6JVE9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LCN8Q6JVE9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LCN8Q6JVE9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LCN8Q6JVE9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LCN8Q6JVE9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCN8Q6JVE9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCN8Q6JVE9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCN8Q6JVE9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCN8Q6JVE9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCN8Q6JVE9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCN8Q6JVE9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCN8Q6JVE9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCN8Q6JVE9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCN8Q6JVE9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCN8Q6JVE9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCN8Q6JVE9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LCN8Q6JVE9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LCN8Q6JVE9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LCN8Q6JVE9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LCN8Q6JVE9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LCN8Q6JVE9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LCN8Q6JVE9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LCN8Q6JVE9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LCN8Q6JVE9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LCN8Q6JVE9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LCN8Q6JVE9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
LCN8Q6JVE9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LCN8Q6JVE9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LCN8Q6JVE9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LCN8Q6JVE9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LCN8Q6JVE9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
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LCN8Q6JVE9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LCN8Q6JVE9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LCN8Q6JVE9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LCN8Q6JVE9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LCN8Q6JVE9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LCN8Q6JVE9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LCN8Q6JVE9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LCN8Q6JVE9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LCN8Q6JVE9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
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LCN8Q6JVE9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LCN8Q6JVE9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LCN8Q6JVE9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LCN8Q6JVE9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LCN8Q6JVE9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LCN8Q6JVE9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LCN8Q6JVE9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
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LCN8Q6JVE9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
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LCN8Q6JVE9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCN8Q6JVE9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCN8Q6JVE9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCN8Q6JVE9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCN8Q6JVE9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCN8Q6JVE9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCN8Q6JVE9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
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LCN8Q6JVE9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCN8Q6JVE9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCN8Q6JVE9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCN8Q6JVE9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCN8Q6JVE9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCN8Q6JVE9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCN8Q6JVE9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCN8Q6JVE9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCN8Q6JVE9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCN8Q6JVE9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCN8Q6JVE9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCN8Q6JVE9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCN8Q6JVE9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCN8Q6JVE9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LCN8Q6JVE9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LCN8Q6JVE9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LCN8Q6JVE9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LCN8Q6JVE9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LCN8Q6JVE9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCN8Q6JVE9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCN8Q6JVE9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCN8Q6JVE9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCN8Q6JVE9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCN8Q6JVE9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCN8Q6JVE9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LCN8Q6JVE9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCN8Q6JVE9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCN8Q6JVE9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCN8Q6JVE9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCN8Q6JVE9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCN8Q6JVE9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCN8Q6JVE9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCN8Q6JVE9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
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