Protein–RNA interactions for Protein: Q6IMN6

CAPRIN2, Caprin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN2Q6IMN6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPRIN2Q6IMN6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPRIN2Q6IMN6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPRIN2Q6IMN6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPRIN2Q6IMN6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPRIN2Q6IMN6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPRIN2Q6IMN6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPRIN2Q6IMN6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPRIN2Q6IMN6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CAPRIN2Q6IMN6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CAPRIN2Q6IMN6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAPRIN2Q6IMN6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAPRIN2Q6IMN6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CAPRIN2Q6IMN6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAPRIN2Q6IMN6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAPRIN2Q6IMN6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAPRIN2Q6IMN6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAPRIN2Q6IMN6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAPRIN2Q6IMN6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAPRIN2Q6IMN6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAPRIN2Q6IMN6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPRIN2Q6IMN6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPRIN2Q6IMN6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPRIN2Q6IMN6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPRIN2Q6IMN6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPRIN2Q6IMN6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPRIN2Q6IMN6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPRIN2Q6IMN6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPRIN2Q6IMN6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPRIN2Q6IMN6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPRIN2Q6IMN6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPRIN2Q6IMN6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPRIN2Q6IMN6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPRIN2Q6IMN6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPRIN2Q6IMN6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPRIN2Q6IMN6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPRIN2Q6IMN6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPRIN2Q6IMN6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPRIN2Q6IMN6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPRIN2Q6IMN6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPRIN2Q6IMN6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPRIN2Q6IMN6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPRIN2Q6IMN6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPRIN2Q6IMN6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPRIN2Q6IMN6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPRIN2Q6IMN6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPRIN2Q6IMN6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPRIN2Q6IMN6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAPRIN2Q6IMN6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAPRIN2Q6IMN6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAPRIN2Q6IMN6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAPRIN2Q6IMN6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAPRIN2Q6IMN6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAPRIN2Q6IMN6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAPRIN2Q6IMN6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAPRIN2Q6IMN6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CAPRIN2Q6IMN6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPRIN2Q6IMN6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPRIN2Q6IMN6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPRIN2Q6IMN6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPRIN2Q6IMN6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPRIN2Q6IMN6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPRIN2Q6IMN6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPRIN2Q6IMN6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPRIN2Q6IMN6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPRIN2Q6IMN6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPRIN2Q6IMN6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPRIN2Q6IMN6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPRIN2Q6IMN6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPRIN2Q6IMN6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPRIN2Q6IMN6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPRIN2Q6IMN6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPRIN2Q6IMN6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPRIN2Q6IMN6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPRIN2Q6IMN6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPRIN2Q6IMN6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPRIN2Q6IMN6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPRIN2Q6IMN6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPRIN2Q6IMN6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPRIN2Q6IMN6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPRIN2Q6IMN6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPRIN2Q6IMN6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPRIN2Q6IMN6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPRIN2Q6IMN6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPRIN2Q6IMN6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPRIN2Q6IMN6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPRIN2Q6IMN6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPRIN2Q6IMN6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPRIN2Q6IMN6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPRIN2Q6IMN6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPRIN2Q6IMN6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPRIN2Q6IMN6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPRIN2Q6IMN6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPRIN2Q6IMN6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPRIN2Q6IMN6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPRIN2Q6IMN6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPRIN2Q6IMN6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPRIN2Q6IMN6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPRIN2Q6IMN6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPRIN2Q6IMN6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms