Protein–RNA interactions for Protein: Q6IC98

GRAMD4, GRAM domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD4Q6IC98 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRAMD4Q6IC98 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRAMD4Q6IC98 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRAMD4Q6IC98 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRAMD4Q6IC98 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRAMD4Q6IC98 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRAMD4Q6IC98 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRAMD4Q6IC98 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
GRAMD4Q6IC98 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRAMD4Q6IC98 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRAMD4Q6IC98 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRAMD4Q6IC98 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRAMD4Q6IC98 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRAMD4Q6IC98 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GRAMD4Q6IC98 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRAMD4Q6IC98 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRAMD4Q6IC98 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRAMD4Q6IC98 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRAMD4Q6IC98 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRAMD4Q6IC98 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRAMD4Q6IC98 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRAMD4Q6IC98 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRAMD4Q6IC98 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRAMD4Q6IC98 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRAMD4Q6IC98 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRAMD4Q6IC98 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRAMD4Q6IC98 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRAMD4Q6IC98 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRAMD4Q6IC98 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRAMD4Q6IC98 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRAMD4Q6IC98 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRAMD4Q6IC98 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRAMD4Q6IC98 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRAMD4Q6IC98 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRAMD4Q6IC98 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRAMD4Q6IC98 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GRAMD4Q6IC98 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRAMD4Q6IC98 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRAMD4Q6IC98 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRAMD4Q6IC98 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRAMD4Q6IC98 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRAMD4Q6IC98 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRAMD4Q6IC98 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRAMD4Q6IC98 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GRAMD4Q6IC98 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRAMD4Q6IC98 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRAMD4Q6IC98 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRAMD4Q6IC98 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRAMD4Q6IC98 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRAMD4Q6IC98 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRAMD4Q6IC98 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRAMD4Q6IC98 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRAMD4Q6IC98 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRAMD4Q6IC98 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRAMD4Q6IC98 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRAMD4Q6IC98 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRAMD4Q6IC98 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRAMD4Q6IC98 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRAMD4Q6IC98 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRAMD4Q6IC98 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRAMD4Q6IC98 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRAMD4Q6IC98 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRAMD4Q6IC98 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRAMD4Q6IC98 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRAMD4Q6IC98 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRAMD4Q6IC98 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRAMD4Q6IC98 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRAMD4Q6IC98 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRAMD4Q6IC98 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRAMD4Q6IC98 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GRAMD4Q6IC98 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRAMD4Q6IC98 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRAMD4Q6IC98 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRAMD4Q6IC98 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GRAMD4Q6IC98 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRAMD4Q6IC98 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRAMD4Q6IC98 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GRAMD4Q6IC98 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRAMD4Q6IC98 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRAMD4Q6IC98 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRAMD4Q6IC98 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRAMD4Q6IC98 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRAMD4Q6IC98 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRAMD4Q6IC98 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRAMD4Q6IC98 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRAMD4Q6IC98 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GRAMD4Q6IC98 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRAMD4Q6IC98 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRAMD4Q6IC98 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRAMD4Q6IC98 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRAMD4Q6IC98 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GRAMD4Q6IC98 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GRAMD4Q6IC98 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRAMD4Q6IC98 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRAMD4Q6IC98 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRAMD4Q6IC98 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRAMD4Q6IC98 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRAMD4Q6IC98 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRAMD4Q6IC98 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRAMD4Q6IC98 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms