Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Rftn1Q6A0D4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rftn1Q6A0D4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rftn1Q6A0D4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rftn1Q6A0D4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rftn1Q6A0D4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rftn1Q6A0D4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rftn1Q6A0D4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rftn1Q6A0D4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rftn1Q6A0D4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rftn1Q6A0D4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rftn1Q6A0D4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rftn1Q6A0D4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rftn1Q6A0D4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rftn1Q6A0D4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Rftn1Q6A0D4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rftn1Q6A0D4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rftn1Q6A0D4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rftn1Q6A0D4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rftn1Q6A0D4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rftn1Q6A0D4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rftn1Q6A0D4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rftn1Q6A0D4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Rftn1Q6A0D4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rftn1Q6A0D4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rftn1Q6A0D4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rftn1Q6A0D4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rftn1Q6A0D4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rftn1Q6A0D4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rftn1Q6A0D4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rftn1Q6A0D4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rftn1Q6A0D4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rftn1Q6A0D4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rftn1Q6A0D4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rftn1Q6A0D4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Rftn1Q6A0D4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rftn1Q6A0D4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rftn1Q6A0D4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Rftn1Q6A0D4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rftn1Q6A0D4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rftn1Q6A0D4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rftn1Q6A0D4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rftn1Q6A0D4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rftn1Q6A0D4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rftn1Q6A0D4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rftn1Q6A0D4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rftn1Q6A0D4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rftn1Q6A0D4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rftn1Q6A0D4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rftn1Q6A0D4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rftn1Q6A0D4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rftn1Q6A0D4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rftn1Q6A0D4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rftn1Q6A0D4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rftn1Q6A0D4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rftn1Q6A0D4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rftn1Q6A0D4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rftn1Q6A0D4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rftn1Q6A0D4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rftn1Q6A0D4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rftn1Q6A0D4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rftn1Q6A0D4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rftn1Q6A0D4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rftn1Q6A0D4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rftn1Q6A0D4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rftn1Q6A0D4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rftn1Q6A0D4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rftn1Q6A0D4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rftn1Q6A0D4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rftn1Q6A0D4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rftn1Q6A0D4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rftn1Q6A0D4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rftn1Q6A0D4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Rftn1Q6A0D4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rftn1Q6A0D4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rftn1Q6A0D4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rftn1Q6A0D4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rftn1Q6A0D4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rftn1Q6A0D4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Rftn1Q6A0D4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rftn1Q6A0D4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rftn1Q6A0D4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rftn1Q6A0D4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rftn1Q6A0D4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rftn1Q6A0D4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rftn1Q6A0D4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rftn1Q6A0D4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rftn1Q6A0D4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rftn1Q6A0D4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rftn1Q6A0D4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rftn1Q6A0D4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rftn1Q6A0D4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rftn1Q6A0D4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rftn1Q6A0D4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rftn1Q6A0D4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rftn1Q6A0D4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rftn1Q6A0D4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rftn1Q6A0D4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rftn1Q6A0D4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rftn1Q6A0D4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 234.7 ms