Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD7

Fnip1, Folliculin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fnip1Q68FD7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Fnip1Q68FD7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Fnip1Q68FD7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fnip1Q68FD7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fnip1Q68FD7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fnip1Q68FD7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fnip1Q68FD7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fnip1Q68FD7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fnip1Q68FD7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fnip1Q68FD7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fnip1Q68FD7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fnip1Q68FD7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fnip1Q68FD7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fnip1Q68FD7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fnip1Q68FD7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fnip1Q68FD7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fnip1Q68FD7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fnip1Q68FD7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fnip1Q68FD7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fnip1Q68FD7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fnip1Q68FD7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fnip1Q68FD7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fnip1Q68FD7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fnip1Q68FD7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fnip1Q68FD7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fnip1Q68FD7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fnip1Q68FD7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fnip1Q68FD7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fnip1Q68FD7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fnip1Q68FD7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fnip1Q68FD7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fnip1Q68FD7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fnip1Q68FD7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fnip1Q68FD7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fnip1Q68FD7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fnip1Q68FD7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fnip1Q68FD7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fnip1Q68FD7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fnip1Q68FD7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fnip1Q68FD7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fnip1Q68FD7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fnip1Q68FD7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Fnip1Q68FD7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fnip1Q68FD7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fnip1Q68FD7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Fnip1Q68FD7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fnip1Q68FD7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fnip1Q68FD7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fnip1Q68FD7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fnip1Q68FD7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fnip1Q68FD7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fnip1Q68FD7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fnip1Q68FD7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fnip1Q68FD7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fnip1Q68FD7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fnip1Q68FD7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fnip1Q68FD7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fnip1Q68FD7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fnip1Q68FD7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fnip1Q68FD7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fnip1Q68FD7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fnip1Q68FD7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fnip1Q68FD7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fnip1Q68FD7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fnip1Q68FD7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fnip1Q68FD7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fnip1Q68FD7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fnip1Q68FD7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fnip1Q68FD7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fnip1Q68FD7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fnip1Q68FD7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fnip1Q68FD7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fnip1Q68FD7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fnip1Q68FD7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fnip1Q68FD7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fnip1Q68FD7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fnip1Q68FD7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fnip1Q68FD7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Fnip1Q68FD7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fnip1Q68FD7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fnip1Q68FD7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fnip1Q68FD7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fnip1Q68FD7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fnip1Q68FD7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fnip1Q68FD7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Fnip1Q68FD7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Fnip1Q68FD7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fnip1Q68FD7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fnip1Q68FD7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fnip1Q68FD7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fnip1Q68FD7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fnip1Q68FD7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fnip1Q68FD7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fnip1Q68FD7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fnip1Q68FD7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fnip1Q68FD7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fnip1Q68FD7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fnip1Q68FD7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fnip1Q68FD7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fnip1Q68FD7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms