Protein–RNA interactions for Protein: Q68E01

INTS3, Integrator complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS3Q68E01 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
INTS3Q68E01 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
INTS3Q68E01 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
INTS3Q68E01 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
INTS3Q68E01 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
INTS3Q68E01 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
INTS3Q68E01 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
INTS3Q68E01 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
INTS3Q68E01 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
INTS3Q68E01 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
INTS3Q68E01 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
INTS3Q68E01 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
INTS3Q68E01 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
INTS3Q68E01 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
INTS3Q68E01 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
INTS3Q68E01 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
INTS3Q68E01 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
INTS3Q68E01 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
INTS3Q68E01 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
INTS3Q68E01 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
INTS3Q68E01 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
INTS3Q68E01 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
INTS3Q68E01 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
INTS3Q68E01 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
INTS3Q68E01 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
INTS3Q68E01 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
INTS3Q68E01 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
INTS3Q68E01 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
INTS3Q68E01 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
INTS3Q68E01 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
INTS3Q68E01 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
INTS3Q68E01 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
INTS3Q68E01 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
INTS3Q68E01 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
INTS3Q68E01 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
INTS3Q68E01 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
INTS3Q68E01 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
INTS3Q68E01 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
INTS3Q68E01 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
INTS3Q68E01 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
INTS3Q68E01 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
INTS3Q68E01 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
INTS3Q68E01 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
INTS3Q68E01 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
INTS3Q68E01 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
INTS3Q68E01 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
INTS3Q68E01 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
INTS3Q68E01 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
INTS3Q68E01 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
INTS3Q68E01 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
INTS3Q68E01 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
INTS3Q68E01 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
INTS3Q68E01 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
INTS3Q68E01 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
INTS3Q68E01 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
INTS3Q68E01 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
INTS3Q68E01 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
INTS3Q68E01 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
INTS3Q68E01 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
INTS3Q68E01 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
INTS3Q68E01 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
INTS3Q68E01 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
INTS3Q68E01 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
INTS3Q68E01 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
INTS3Q68E01 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
INTS3Q68E01 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
INTS3Q68E01 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
INTS3Q68E01 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
INTS3Q68E01 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
INTS3Q68E01 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
INTS3Q68E01 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
INTS3Q68E01 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
INTS3Q68E01 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.37
INTS3Q68E01 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
INTS3Q68E01 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
INTS3Q68E01 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
INTS3Q68E01 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
INTS3Q68E01 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
INTS3Q68E01 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
INTS3Q68E01 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
INTS3Q68E01 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
INTS3Q68E01 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
INTS3Q68E01 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
INTS3Q68E01 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
INTS3Q68E01 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
INTS3Q68E01 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
INTS3Q68E01 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
INTS3Q68E01 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
INTS3Q68E01 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
INTS3Q68E01 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
INTS3Q68E01 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
INTS3Q68E01 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
INTS3Q68E01 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
INTS3Q68E01 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
INTS3Q68E01 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
INTS3Q68E01 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
INTS3Q68E01 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
INTS3Q68E01 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
INTS3Q68E01 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
INTS3Q68E01 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.4 ms