Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Top2bQ64511 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
Top2bQ64511 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Top2bQ64511 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC36.26■■■■□ 3.39
Top2bQ64511 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Top2bQ64511 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC36.26■■■■□ 3.39
Top2bQ64511 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Top2bQ64511 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Top2bQ64511 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Top2bQ64511 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Top2bQ64511 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Top2bQ64511 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Top2bQ64511 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
Top2bQ64511 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Top2bQ64511 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Top2bQ64511 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Top2bQ64511 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
Top2bQ64511 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
Top2bQ64511 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Top2bQ64511 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Top2bQ64511 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Top2bQ64511 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Top2bQ64511 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC36.2■■■■□ 3.39
Top2bQ64511 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Top2bQ64511 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Top2bQ64511 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Top2bQ64511 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Top2bQ64511 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Top2bQ64511 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC36.18■■■■□ 3.38
Top2bQ64511 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Top2bQ64511 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Top2bQ64511 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Top2bQ64511 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Top2bQ64511 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Top2bQ64511 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Top2bQ64511 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Top2bQ64511 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Top2bQ64511 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Top2bQ64511 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Top2bQ64511 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Top2bQ64511 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
Top2bQ64511 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Top2bQ64511 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Top2bQ64511 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Top2bQ64511 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Top2bQ64511 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
Top2bQ64511 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
Top2bQ64511 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
Top2bQ64511 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Top2bQ64511 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Top2bQ64511 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Top2bQ64511 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
Top2bQ64511 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
Top2bQ64511 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
Top2bQ64511 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Top2bQ64511 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Top2bQ64511 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Top2bQ64511 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Top2bQ64511 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Top2bQ64511 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Top2bQ64511 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Top2bQ64511 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Top2bQ64511 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Top2bQ64511 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Top2bQ64511 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Top2bQ64511 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Top2bQ64511 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Top2bQ64511 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Top2bQ64511 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Top2bQ64511 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC36.09■■■■□ 3.37
Top2bQ64511 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Top2bQ64511 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Top2bQ64511 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Top2bQ64511 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Top2bQ64511 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Top2bQ64511 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Top2bQ64511 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Top2bQ64511 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
Top2bQ64511 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
Top2bQ64511 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Top2bQ64511 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Top2bQ64511 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Top2bQ64511 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Top2bQ64511 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Top2bQ64511 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Top2bQ64511 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Top2bQ64511 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Top2bQ64511 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
Top2bQ64511 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Top2bQ64511 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Top2bQ64511 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Top2bQ64511 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Top2bQ64511 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Top2bQ64511 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Top2bQ64511 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Top2bQ64511 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Top2bQ64511 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Top2bQ64511 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Top2bQ64511 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Top2bQ64511 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 195.6 ms