Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim24Q64127 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim24Q64127 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim24Q64127 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim24Q64127 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim24Q64127 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim24Q64127 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim24Q64127 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim24Q64127 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim24Q64127 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trim24Q64127 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trim24Q64127 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trim24Q64127 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim24Q64127 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim24Q64127 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim24Q64127 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim24Q64127 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim24Q64127 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim24Q64127 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim24Q64127 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim24Q64127 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim24Q64127 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim24Q64127 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim24Q64127 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim24Q64127 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim24Q64127 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim24Q64127 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim24Q64127 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim24Q64127 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim24Q64127 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim24Q64127 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim24Q64127 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim24Q64127 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim24Q64127 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim24Q64127 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim24Q64127 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim24Q64127 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim24Q64127 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim24Q64127 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim24Q64127 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim24Q64127 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim24Q64127 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim24Q64127 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim24Q64127 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim24Q64127 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim24Q64127 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim24Q64127 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim24Q64127 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim24Q64127 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim24Q64127 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim24Q64127 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim24Q64127 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim24Q64127 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim24Q64127 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim24Q64127 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim24Q64127 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim24Q64127 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim24Q64127 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trim24Q64127 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trim24Q64127 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Trim24Q64127 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Trim24Q64127 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim24Q64127 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim24Q64127 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim24Q64127 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim24Q64127 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim24Q64127 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim24Q64127 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim24Q64127 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim24Q64127 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Trim24Q64127 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim24Q64127 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim24Q64127 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim24Q64127 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Trim24Q64127 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Trim24Q64127 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim24Q64127 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim24Q64127 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim24Q64127 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim24Q64127 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Trim24Q64127 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Trim24Q64127 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim24Q64127 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim24Q64127 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim24Q64127 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Trim24Q64127 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim24Q64127 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim24Q64127 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim24Q64127 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim24Q64127 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Trim24Q64127 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Trim24Q64127 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim24Q64127 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trim24Q64127 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trim24Q64127 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trim24Q64127 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Trim24Q64127 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Trim24Q64127 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Trim24Q64127 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim24Q64127 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.9 ms