Protein–RNA interactions for Protein: Q62191

Trim21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim21Q62191 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim21Q62191 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim21Q62191 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim21Q62191 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim21Q62191 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim21Q62191 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim21Q62191 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim21Q62191 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim21Q62191 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim21Q62191 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim21Q62191 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim21Q62191 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim21Q62191 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim21Q62191 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trim21Q62191 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trim21Q62191 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim21Q62191 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim21Q62191 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim21Q62191 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim21Q62191 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim21Q62191 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim21Q62191 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim21Q62191 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim21Q62191 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim21Q62191 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim21Q62191 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim21Q62191 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim21Q62191 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim21Q62191 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim21Q62191 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim21Q62191 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim21Q62191 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim21Q62191 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim21Q62191 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim21Q62191 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim21Q62191 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim21Q62191 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim21Q62191 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim21Q62191 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim21Q62191 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim21Q62191 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim21Q62191 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim21Q62191 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim21Q62191 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim21Q62191 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim21Q62191 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim21Q62191 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim21Q62191 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim21Q62191 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim21Q62191 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim21Q62191 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim21Q62191 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim21Q62191 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim21Q62191 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim21Q62191 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim21Q62191 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trim21Q62191 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim21Q62191 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim21Q62191 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim21Q62191 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim21Q62191 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim21Q62191 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim21Q62191 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim21Q62191 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim21Q62191 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim21Q62191 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim21Q62191 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim21Q62191 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim21Q62191 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim21Q62191 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim21Q62191 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim21Q62191 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim21Q62191 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim21Q62191 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim21Q62191 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim21Q62191 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim21Q62191 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim21Q62191 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim21Q62191 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim21Q62191 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim21Q62191 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim21Q62191 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim21Q62191 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim21Q62191 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim21Q62191 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim21Q62191 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim21Q62191 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim21Q62191 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim21Q62191 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim21Q62191 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim21Q62191 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim21Q62191 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim21Q62191 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim21Q62191 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim21Q62191 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim21Q62191 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim21Q62191 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim21Q62191 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim21Q62191 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim21Q62191 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.5 ms