Protein–RNA interactions for Protein: Q61897

Krt33b, Keratin, type I cuticular Ha3-II, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt33bQ61897 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt33bQ61897 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt33bQ61897 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt33bQ61897 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt33bQ61897 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt33bQ61897 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt33bQ61897 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt33bQ61897 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt33bQ61897 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt33bQ61897 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt33bQ61897 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt33bQ61897 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt33bQ61897 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt33bQ61897 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt33bQ61897 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt33bQ61897 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt33bQ61897 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt33bQ61897 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt33bQ61897 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt33bQ61897 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt33bQ61897 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt33bQ61897 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt33bQ61897 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt33bQ61897 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt33bQ61897 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt33bQ61897 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt33bQ61897 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt33bQ61897 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Krt33bQ61897 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Krt33bQ61897 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt33bQ61897 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt33bQ61897 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt33bQ61897 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt33bQ61897 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt33bQ61897 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt33bQ61897 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt33bQ61897 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt33bQ61897 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt33bQ61897 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt33bQ61897 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt33bQ61897 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt33bQ61897 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt33bQ61897 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt33bQ61897 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt33bQ61897 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt33bQ61897 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt33bQ61897 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt33bQ61897 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt33bQ61897 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt33bQ61897 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt33bQ61897 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt33bQ61897 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt33bQ61897 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt33bQ61897 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt33bQ61897 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt33bQ61897 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt33bQ61897 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt33bQ61897 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt33bQ61897 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt33bQ61897 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt33bQ61897 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt33bQ61897 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt33bQ61897 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt33bQ61897 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt33bQ61897 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt33bQ61897 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt33bQ61897 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt33bQ61897 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt33bQ61897 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt33bQ61897 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt33bQ61897 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt33bQ61897 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt33bQ61897 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt33bQ61897 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt33bQ61897 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt33bQ61897 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt33bQ61897 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt33bQ61897 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt33bQ61897 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt33bQ61897 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt33bQ61897 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt33bQ61897 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt33bQ61897 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt33bQ61897 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt33bQ61897 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt33bQ61897 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt33bQ61897 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt33bQ61897 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Krt33bQ61897 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Krt33bQ61897 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Krt33bQ61897 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Krt33bQ61897 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt33bQ61897 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt33bQ61897 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt33bQ61897 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt33bQ61897 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt33bQ61897 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt33bQ61897 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt33bQ61897 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt33bQ61897 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms