Protein–RNA interactions for Protein: Q61330

Cntn2, Contactin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn2Q61330 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cntn2Q61330 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cntn2Q61330 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cntn2Q61330 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cntn2Q61330 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cntn2Q61330 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cntn2Q61330 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cntn2Q61330 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cntn2Q61330 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cntn2Q61330 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cntn2Q61330 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cntn2Q61330 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cntn2Q61330 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cntn2Q61330 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cntn2Q61330 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cntn2Q61330 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cntn2Q61330 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cntn2Q61330 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cntn2Q61330 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cntn2Q61330 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cntn2Q61330 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cntn2Q61330 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cntn2Q61330 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cntn2Q61330 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cntn2Q61330 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cntn2Q61330 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cntn2Q61330 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cntn2Q61330 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cntn2Q61330 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cntn2Q61330 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cntn2Q61330 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cntn2Q61330 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cntn2Q61330 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cntn2Q61330 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cntn2Q61330 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cntn2Q61330 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cntn2Q61330 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cntn2Q61330 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cntn2Q61330 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cntn2Q61330 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cntn2Q61330 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cntn2Q61330 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cntn2Q61330 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cntn2Q61330 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cntn2Q61330 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cntn2Q61330 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cntn2Q61330 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cntn2Q61330 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cntn2Q61330 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cntn2Q61330 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cntn2Q61330 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cntn2Q61330 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cntn2Q61330 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cntn2Q61330 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cntn2Q61330 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cntn2Q61330 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cntn2Q61330 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cntn2Q61330 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cntn2Q61330 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cntn2Q61330 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cntn2Q61330 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cntn2Q61330 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cntn2Q61330 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cntn2Q61330 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cntn2Q61330 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cntn2Q61330 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cntn2Q61330 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cntn2Q61330 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cntn2Q61330 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cntn2Q61330 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cntn2Q61330 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cntn2Q61330 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cntn2Q61330 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cntn2Q61330 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cntn2Q61330 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cntn2Q61330 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cntn2Q61330 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cntn2Q61330 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cntn2Q61330 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cntn2Q61330 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cntn2Q61330 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cntn2Q61330 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cntn2Q61330 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cntn2Q61330 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cntn2Q61330 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cntn2Q61330 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cntn2Q61330 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cntn2Q61330 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cntn2Q61330 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cntn2Q61330 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cntn2Q61330 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cntn2Q61330 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cntn2Q61330 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cntn2Q61330 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cntn2Q61330 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cntn2Q61330 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cntn2Q61330 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cntn2Q61330 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cntn2Q61330 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cntn2Q61330 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 159 ms