Protein–RNA interactions for Protein: Q61315

Apc, Adenomatous polyposis coli protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,845 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApcQ61315 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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ApcQ61315 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ApcQ61315 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ApcQ61315 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ApcQ61315 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ApcQ61315 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ApcQ61315 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ApcQ61315 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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ApcQ61315 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ApcQ61315 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ApcQ61315 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ApcQ61315 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ApcQ61315 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ApcQ61315 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ApcQ61315 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ApcQ61315 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ApcQ61315 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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ApcQ61315 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ApcQ61315 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ApcQ61315 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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ApcQ61315 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ApcQ61315 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ApcQ61315 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ApcQ61315 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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ApcQ61315 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ApcQ61315 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ApcQ61315 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ApcQ61315 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ApcQ61315 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ApcQ61315 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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ApcQ61315 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ApcQ61315 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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ApcQ61315 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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ApcQ61315 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ApcQ61315 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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ApcQ61315 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ApcQ61315 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ApcQ61315 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ApcQ61315 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ApcQ61315 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ApcQ61315 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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ApcQ61315 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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ApcQ61315 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ApcQ61315 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ApcQ61315 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ApcQ61315 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ApcQ61315 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ApcQ61315 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ApcQ61315 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ApcQ61315 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ApcQ61315 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ApcQ61315 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ApcQ61315 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ApcQ61315 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ApcQ61315 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ApcQ61315 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ApcQ61315 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ApcQ61315 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ApcQ61315 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ApcQ61315 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ApcQ61315 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ApcQ61315 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ApcQ61315 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ApcQ61315 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ApcQ61315 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ApcQ61315 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms