Protein–RNA interactions for Protein: Q61194

Pik3c2a, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3c2aQ61194 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Pik3c2aQ61194 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Pik3c2aQ61194 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Pik3c2aQ61194 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Pik3c2aQ61194 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Pik3c2aQ61194 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Pik3c2aQ61194 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Pik3c2aQ61194 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Pik3c2aQ61194 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Pik3c2aQ61194 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Pik3c2aQ61194 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Pik3c2aQ61194 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Pik3c2aQ61194 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Pik3c2aQ61194 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Pik3c2aQ61194 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Pik3c2aQ61194 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Pik3c2aQ61194 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Pik3c2aQ61194 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Pik3c2aQ61194 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Pik3c2aQ61194 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Pik3c2aQ61194 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Pik3c2aQ61194 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Pik3c2aQ61194 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Pik3c2aQ61194 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Pik3c2aQ61194 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Pik3c2aQ61194 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Pik3c2aQ61194 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Pik3c2aQ61194 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Pik3c2aQ61194 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Pik3c2aQ61194 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Pik3c2aQ61194 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Pik3c2aQ61194 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Pik3c2aQ61194 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Pik3c2aQ61194 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Pik3c2aQ61194 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Pik3c2aQ61194 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Pik3c2aQ61194 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Pik3c2aQ61194 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Pik3c2aQ61194 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Pik3c2aQ61194 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Pik3c2aQ61194 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Pik3c2aQ61194 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Pik3c2aQ61194 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Pik3c2aQ61194 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Pik3c2aQ61194 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Pik3c2aQ61194 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Pik3c2aQ61194 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Pik3c2aQ61194 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Pik3c2aQ61194 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Pik3c2aQ61194 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Pik3c2aQ61194 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Pik3c2aQ61194 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Pik3c2aQ61194 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Pik3c2aQ61194 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Pik3c2aQ61194 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Pik3c2aQ61194 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Pik3c2aQ61194 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Pik3c2aQ61194 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Pik3c2aQ61194 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Pik3c2aQ61194 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Pik3c2aQ61194 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Pik3c2aQ61194 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Pik3c2aQ61194 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Pik3c2aQ61194 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Pik3c2aQ61194 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Pik3c2aQ61194 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Pik3c2aQ61194 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Pik3c2aQ61194 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Pik3c2aQ61194 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Pik3c2aQ61194 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Pik3c2aQ61194 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Pik3c2aQ61194 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Pik3c2aQ61194 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Pik3c2aQ61194 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Pik3c2aQ61194 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Pik3c2aQ61194 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Pik3c2aQ61194 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Pik3c2aQ61194 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Pik3c2aQ61194 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Pik3c2aQ61194 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Pik3c2aQ61194 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Pik3c2aQ61194 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Pik3c2aQ61194 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Pik3c2aQ61194 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Pik3c2aQ61194 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Pik3c2aQ61194 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Pik3c2aQ61194 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Pik3c2aQ61194 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Pik3c2aQ61194 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Pik3c2aQ61194 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Pik3c2aQ61194 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Pik3c2aQ61194 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Pik3c2aQ61194 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Pik3c2aQ61194 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Pik3c2aQ61194 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Pik3c2aQ61194 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Pik3c2aQ61194 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Pik3c2aQ61194 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Pik3c2aQ61194 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Pik3c2aQ61194 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms