Protein–RNA interactions for Protein: Q61043

Nin, Ninein, mousemouse

Predictions only

Length 2,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinQ61043 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NinQ61043 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NinQ61043 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NinQ61043 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NinQ61043 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NinQ61043 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NinQ61043 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NinQ61043 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NinQ61043 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NinQ61043 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NinQ61043 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NinQ61043 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NinQ61043 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NinQ61043 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NinQ61043 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NinQ61043 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NinQ61043 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NinQ61043 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NinQ61043 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NinQ61043 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NinQ61043 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NinQ61043 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NinQ61043 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NinQ61043 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NinQ61043 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NinQ61043 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NinQ61043 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NinQ61043 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NinQ61043 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NinQ61043 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NinQ61043 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NinQ61043 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NinQ61043 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NinQ61043 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NinQ61043 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NinQ61043 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NinQ61043 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NinQ61043 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NinQ61043 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
NinQ61043 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
NinQ61043 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NinQ61043 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NinQ61043 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NinQ61043 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NinQ61043 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NinQ61043 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NinQ61043 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NinQ61043 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NinQ61043 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NinQ61043 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NinQ61043 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NinQ61043 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NinQ61043 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NinQ61043 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NinQ61043 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NinQ61043 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NinQ61043 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NinQ61043 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NinQ61043 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NinQ61043 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NinQ61043 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NinQ61043 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NinQ61043 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NinQ61043 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NinQ61043 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NinQ61043 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NinQ61043 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NinQ61043 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NinQ61043 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NinQ61043 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NinQ61043 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NinQ61043 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NinQ61043 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NinQ61043 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NinQ61043 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NinQ61043 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NinQ61043 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NinQ61043 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NinQ61043 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NinQ61043 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NinQ61043 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NinQ61043 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NinQ61043 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NinQ61043 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NinQ61043 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NinQ61043 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NinQ61043 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NinQ61043 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NinQ61043 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NinQ61043 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NinQ61043 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NinQ61043 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NinQ61043 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NinQ61043 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NinQ61043 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NinQ61043 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NinQ61043 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NinQ61043 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NinQ61043 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NinQ61043 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms