Protein–RNA interactions for Protein: Q61003

Cd6, T-cell differentiation antigen CD6, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd6Q61003 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd6Q61003 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd6Q61003 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd6Q61003 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd6Q61003 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd6Q61003 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd6Q61003 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd6Q61003 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd6Q61003 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd6Q61003 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd6Q61003 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd6Q61003 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cd6Q61003 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd6Q61003 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd6Q61003 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd6Q61003 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd6Q61003 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd6Q61003 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd6Q61003 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd6Q61003 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd6Q61003 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd6Q61003 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd6Q61003 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd6Q61003 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd6Q61003 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd6Q61003 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd6Q61003 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd6Q61003 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd6Q61003 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd6Q61003 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd6Q61003 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd6Q61003 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd6Q61003 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd6Q61003 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd6Q61003 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd6Q61003 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd6Q61003 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd6Q61003 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd6Q61003 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd6Q61003 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd6Q61003 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd6Q61003 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd6Q61003 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd6Q61003 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd6Q61003 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd6Q61003 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd6Q61003 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cd6Q61003 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cd6Q61003 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cd6Q61003 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cd6Q61003 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cd6Q61003 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cd6Q61003 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cd6Q61003 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cd6Q61003 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cd6Q61003 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cd6Q61003 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cd6Q61003 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd6Q61003 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd6Q61003 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd6Q61003 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd6Q61003 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd6Q61003 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd6Q61003 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd6Q61003 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd6Q61003 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd6Q61003 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd6Q61003 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd6Q61003 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd6Q61003 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd6Q61003 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd6Q61003 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd6Q61003 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd6Q61003 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd6Q61003 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd6Q61003 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd6Q61003 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd6Q61003 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd6Q61003 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd6Q61003 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd6Q61003 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd6Q61003 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd6Q61003 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd6Q61003 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd6Q61003 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd6Q61003 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd6Q61003 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd6Q61003 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd6Q61003 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd6Q61003 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd6Q61003 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd6Q61003 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cd6Q61003 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cd6Q61003 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cd6Q61003 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cd6Q61003 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cd6Q61003 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cd6Q61003 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cd6Q61003 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd6Q61003 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms