Protein–RNA interactions for Protein: Q60715

P4ha1, Prolyl 4-hydroxylase subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P4ha1Q60715 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
P4ha1Q60715 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
P4ha1Q60715 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
P4ha1Q60715 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
P4ha1Q60715 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
P4ha1Q60715 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
P4ha1Q60715 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
P4ha1Q60715 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
P4ha1Q60715 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
P4ha1Q60715 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
P4ha1Q60715 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
P4ha1Q60715 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
P4ha1Q60715 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
P4ha1Q60715 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
P4ha1Q60715 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
P4ha1Q60715 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
P4ha1Q60715 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
P4ha1Q60715 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
P4ha1Q60715 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
P4ha1Q60715 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
P4ha1Q60715 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
P4ha1Q60715 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
P4ha1Q60715 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
P4ha1Q60715 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
P4ha1Q60715 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
P4ha1Q60715 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
P4ha1Q60715 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
P4ha1Q60715 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
P4ha1Q60715 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
P4ha1Q60715 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
P4ha1Q60715 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
P4ha1Q60715 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
P4ha1Q60715 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
P4ha1Q60715 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
P4ha1Q60715 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
P4ha1Q60715 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
P4ha1Q60715 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
P4ha1Q60715 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
P4ha1Q60715 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
P4ha1Q60715 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
P4ha1Q60715 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
P4ha1Q60715 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
P4ha1Q60715 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
P4ha1Q60715 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
P4ha1Q60715 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
P4ha1Q60715 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
P4ha1Q60715 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
P4ha1Q60715 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
P4ha1Q60715 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
P4ha1Q60715 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
P4ha1Q60715 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
P4ha1Q60715 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
P4ha1Q60715 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
P4ha1Q60715 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
P4ha1Q60715 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
P4ha1Q60715 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
P4ha1Q60715 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
P4ha1Q60715 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
P4ha1Q60715 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
P4ha1Q60715 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
P4ha1Q60715 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
P4ha1Q60715 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
P4ha1Q60715 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
P4ha1Q60715 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
P4ha1Q60715 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
P4ha1Q60715 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
P4ha1Q60715 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
P4ha1Q60715 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
P4ha1Q60715 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
P4ha1Q60715 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
P4ha1Q60715 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
P4ha1Q60715 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
P4ha1Q60715 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
P4ha1Q60715 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
P4ha1Q60715 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
P4ha1Q60715 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
P4ha1Q60715 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
P4ha1Q60715 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
P4ha1Q60715 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
P4ha1Q60715 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
P4ha1Q60715 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
P4ha1Q60715 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
P4ha1Q60715 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
P4ha1Q60715 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
P4ha1Q60715 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
P4ha1Q60715 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
P4ha1Q60715 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
P4ha1Q60715 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
P4ha1Q60715 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
P4ha1Q60715 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
P4ha1Q60715 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
P4ha1Q60715 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
P4ha1Q60715 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
P4ha1Q60715 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
P4ha1Q60715 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
P4ha1Q60715 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
P4ha1Q60715 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
P4ha1Q60715 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
P4ha1Q60715 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
P4ha1Q60715 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms