Protein–RNA interactions for Protein: Q5XKE5

KRT79, Keratin, type II cytoskeletal 79, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT79Q5XKE5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KRT79Q5XKE5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KRT79Q5XKE5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KRT79Q5XKE5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KRT79Q5XKE5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KRT79Q5XKE5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KRT79Q5XKE5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
KRT79Q5XKE5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
KRT79Q5XKE5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KRT79Q5XKE5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
KRT79Q5XKE5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KRT79Q5XKE5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KRT79Q5XKE5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KRT79Q5XKE5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KRT79Q5XKE5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KRT79Q5XKE5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KRT79Q5XKE5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT79Q5XKE5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT79Q5XKE5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT79Q5XKE5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT79Q5XKE5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT79Q5XKE5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KRT79Q5XKE5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KRT79Q5XKE5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KRT79Q5XKE5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KRT79Q5XKE5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KRT79Q5XKE5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
KRT79Q5XKE5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
KRT79Q5XKE5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
KRT79Q5XKE5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT79Q5XKE5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT79Q5XKE5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT79Q5XKE5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT79Q5XKE5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT79Q5XKE5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT79Q5XKE5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT79Q5XKE5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT79Q5XKE5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT79Q5XKE5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT79Q5XKE5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT79Q5XKE5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT79Q5XKE5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT79Q5XKE5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT79Q5XKE5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT79Q5XKE5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT79Q5XKE5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT79Q5XKE5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT79Q5XKE5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT79Q5XKE5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT79Q5XKE5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT79Q5XKE5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT79Q5XKE5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT79Q5XKE5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT79Q5XKE5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT79Q5XKE5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT79Q5XKE5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KRT79Q5XKE5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KRT79Q5XKE5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KRT79Q5XKE5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KRT79Q5XKE5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KRT79Q5XKE5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KRT79Q5XKE5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KRT79Q5XKE5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KRT79Q5XKE5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KRT79Q5XKE5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KRT79Q5XKE5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KRT79Q5XKE5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KRT79Q5XKE5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KRT79Q5XKE5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
KRT79Q5XKE5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KRT79Q5XKE5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KRT79Q5XKE5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KRT79Q5XKE5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KRT79Q5XKE5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT79Q5XKE5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT79Q5XKE5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT79Q5XKE5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KRT79Q5XKE5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KRT79Q5XKE5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KRT79Q5XKE5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
KRT79Q5XKE5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KRT79Q5XKE5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KRT79Q5XKE5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KRT79Q5XKE5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
KRT79Q5XKE5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
KRT79Q5XKE5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
KRT79Q5XKE5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KRT79Q5XKE5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT79Q5XKE5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT79Q5XKE5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT79Q5XKE5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT79Q5XKE5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT79Q5XKE5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT79Q5XKE5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT79Q5XKE5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT79Q5XKE5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT79Q5XKE5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT79Q5XKE5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT79Q5XKE5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT79Q5XKE5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms