Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP3

MLIP, Muscular LMNA-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLIPQ5VWP3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MLIPQ5VWP3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MLIPQ5VWP3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MLIPQ5VWP3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MLIPQ5VWP3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MLIPQ5VWP3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MLIPQ5VWP3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MLIPQ5VWP3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MLIPQ5VWP3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MLIPQ5VWP3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MLIPQ5VWP3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MLIPQ5VWP3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MLIPQ5VWP3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MLIPQ5VWP3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MLIPQ5VWP3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MLIPQ5VWP3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MLIPQ5VWP3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MLIPQ5VWP3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MLIPQ5VWP3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MLIPQ5VWP3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MLIPQ5VWP3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MLIPQ5VWP3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MLIPQ5VWP3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MLIPQ5VWP3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MLIPQ5VWP3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MLIPQ5VWP3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MLIPQ5VWP3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MLIPQ5VWP3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MLIPQ5VWP3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MLIPQ5VWP3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MLIPQ5VWP3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MLIPQ5VWP3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MLIPQ5VWP3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MLIPQ5VWP3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MLIPQ5VWP3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MLIPQ5VWP3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MLIPQ5VWP3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MLIPQ5VWP3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MLIPQ5VWP3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MLIPQ5VWP3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MLIPQ5VWP3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MLIPQ5VWP3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MLIPQ5VWP3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MLIPQ5VWP3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MLIPQ5VWP3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MLIPQ5VWP3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MLIPQ5VWP3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MLIPQ5VWP3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MLIPQ5VWP3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MLIPQ5VWP3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MLIPQ5VWP3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MLIPQ5VWP3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MLIPQ5VWP3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MLIPQ5VWP3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MLIPQ5VWP3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MLIPQ5VWP3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MLIPQ5VWP3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MLIPQ5VWP3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MLIPQ5VWP3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MLIPQ5VWP3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MLIPQ5VWP3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MLIPQ5VWP3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MLIPQ5VWP3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MLIPQ5VWP3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MLIPQ5VWP3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MLIPQ5VWP3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MLIPQ5VWP3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MLIPQ5VWP3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MLIPQ5VWP3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MLIPQ5VWP3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MLIPQ5VWP3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MLIPQ5VWP3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MLIPQ5VWP3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MLIPQ5VWP3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MLIPQ5VWP3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MLIPQ5VWP3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MLIPQ5VWP3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MLIPQ5VWP3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MLIPQ5VWP3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MLIPQ5VWP3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MLIPQ5VWP3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MLIPQ5VWP3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MLIPQ5VWP3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MLIPQ5VWP3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MLIPQ5VWP3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MLIPQ5VWP3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MLIPQ5VWP3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MLIPQ5VWP3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MLIPQ5VWP3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MLIPQ5VWP3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MLIPQ5VWP3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MLIPQ5VWP3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MLIPQ5VWP3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MLIPQ5VWP3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MLIPQ5VWP3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MLIPQ5VWP3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MLIPQ5VWP3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MLIPQ5VWP3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MLIPQ5VWP3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MLIPQ5VWP3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms