Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWJ9

SNX30, Sorting nexin-30, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX30Q5VWJ9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNX30Q5VWJ9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNX30Q5VWJ9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SNX30Q5VWJ9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNX30Q5VWJ9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SNX30Q5VWJ9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX30Q5VWJ9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX30Q5VWJ9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX30Q5VWJ9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX30Q5VWJ9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX30Q5VWJ9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX30Q5VWJ9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX30Q5VWJ9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX30Q5VWJ9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX30Q5VWJ9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX30Q5VWJ9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX30Q5VWJ9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX30Q5VWJ9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX30Q5VWJ9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX30Q5VWJ9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX30Q5VWJ9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX30Q5VWJ9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX30Q5VWJ9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX30Q5VWJ9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX30Q5VWJ9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX30Q5VWJ9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX30Q5VWJ9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX30Q5VWJ9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX30Q5VWJ9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX30Q5VWJ9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX30Q5VWJ9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX30Q5VWJ9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX30Q5VWJ9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX30Q5VWJ9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX30Q5VWJ9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX30Q5VWJ9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX30Q5VWJ9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX30Q5VWJ9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX30Q5VWJ9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX30Q5VWJ9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX30Q5VWJ9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX30Q5VWJ9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX30Q5VWJ9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX30Q5VWJ9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX30Q5VWJ9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX30Q5VWJ9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX30Q5VWJ9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX30Q5VWJ9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX30Q5VWJ9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX30Q5VWJ9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX30Q5VWJ9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX30Q5VWJ9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX30Q5VWJ9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX30Q5VWJ9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX30Q5VWJ9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX30Q5VWJ9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX30Q5VWJ9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX30Q5VWJ9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX30Q5VWJ9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX30Q5VWJ9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX30Q5VWJ9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX30Q5VWJ9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX30Q5VWJ9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX30Q5VWJ9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX30Q5VWJ9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX30Q5VWJ9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX30Q5VWJ9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX30Q5VWJ9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX30Q5VWJ9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX30Q5VWJ9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX30Q5VWJ9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX30Q5VWJ9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX30Q5VWJ9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX30Q5VWJ9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX30Q5VWJ9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX30Q5VWJ9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX30Q5VWJ9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX30Q5VWJ9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX30Q5VWJ9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX30Q5VWJ9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX30Q5VWJ9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX30Q5VWJ9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX30Q5VWJ9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX30Q5VWJ9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX30Q5VWJ9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX30Q5VWJ9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX30Q5VWJ9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX30Q5VWJ9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX30Q5VWJ9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX30Q5VWJ9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX30Q5VWJ9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX30Q5VWJ9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX30Q5VWJ9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX30Q5VWJ9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX30Q5VWJ9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX30Q5VWJ9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX30Q5VWJ9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX30Q5VWJ9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX30Q5VWJ9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNX30Q5VWJ9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.7 ms