Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0J3

C1orf220, Putative uncharacterized protein C1orf220, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf220Q5T0J3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
C1orf220Q5T0J3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
C1orf220Q5T0J3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
C1orf220Q5T0J3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
C1orf220Q5T0J3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
C1orf220Q5T0J3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
C1orf220Q5T0J3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
C1orf220Q5T0J3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
C1orf220Q5T0J3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
C1orf220Q5T0J3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
C1orf220Q5T0J3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
C1orf220Q5T0J3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
C1orf220Q5T0J3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
C1orf220Q5T0J3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
C1orf220Q5T0J3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
C1orf220Q5T0J3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
C1orf220Q5T0J3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
C1orf220Q5T0J3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
C1orf220Q5T0J3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
C1orf220Q5T0J3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
C1orf220Q5T0J3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
C1orf220Q5T0J3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
C1orf220Q5T0J3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
C1orf220Q5T0J3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
C1orf220Q5T0J3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
C1orf220Q5T0J3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
C1orf220Q5T0J3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
C1orf220Q5T0J3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
C1orf220Q5T0J3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
C1orf220Q5T0J3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
C1orf220Q5T0J3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
C1orf220Q5T0J3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
C1orf220Q5T0J3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
C1orf220Q5T0J3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
C1orf220Q5T0J3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
C1orf220Q5T0J3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
C1orf220Q5T0J3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
C1orf220Q5T0J3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
C1orf220Q5T0J3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
C1orf220Q5T0J3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
C1orf220Q5T0J3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
C1orf220Q5T0J3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
C1orf220Q5T0J3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
C1orf220Q5T0J3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
C1orf220Q5T0J3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
C1orf220Q5T0J3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
C1orf220Q5T0J3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
C1orf220Q5T0J3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
C1orf220Q5T0J3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
C1orf220Q5T0J3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
C1orf220Q5T0J3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
C1orf220Q5T0J3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
C1orf220Q5T0J3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
C1orf220Q5T0J3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
C1orf220Q5T0J3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
C1orf220Q5T0J3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
C1orf220Q5T0J3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
C1orf220Q5T0J3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
C1orf220Q5T0J3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
C1orf220Q5T0J3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
C1orf220Q5T0J3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
C1orf220Q5T0J3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
C1orf220Q5T0J3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
C1orf220Q5T0J3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
C1orf220Q5T0J3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
C1orf220Q5T0J3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
C1orf220Q5T0J3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
C1orf220Q5T0J3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
C1orf220Q5T0J3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
C1orf220Q5T0J3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
C1orf220Q5T0J3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
C1orf220Q5T0J3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C1orf220Q5T0J3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C1orf220Q5T0J3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C1orf220Q5T0J3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
C1orf220Q5T0J3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
C1orf220Q5T0J3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
C1orf220Q5T0J3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
C1orf220Q5T0J3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
C1orf220Q5T0J3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
C1orf220Q5T0J3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
C1orf220Q5T0J3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
C1orf220Q5T0J3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C1orf220Q5T0J3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
C1orf220Q5T0J3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C1orf220Q5T0J3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
C1orf220Q5T0J3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C1orf220Q5T0J3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C1orf220Q5T0J3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
C1orf220Q5T0J3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C1orf220Q5T0J3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C1orf220Q5T0J3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C1orf220Q5T0J3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C1orf220Q5T0J3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
C1orf220Q5T0J3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
C1orf220Q5T0J3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C1orf220Q5T0J3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
C1orf220Q5T0J3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
C1orf220Q5T0J3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
C1orf220Q5T0J3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.5 ms