Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXY1

Specc1, Cytospin-B, mousemouse

Predictions only

Length 1,067 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Specc1Q5SXY1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Specc1Q5SXY1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Specc1Q5SXY1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Specc1Q5SXY1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Specc1Q5SXY1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Specc1Q5SXY1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Specc1Q5SXY1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Specc1Q5SXY1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Specc1Q5SXY1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Specc1Q5SXY1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Specc1Q5SXY1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Specc1Q5SXY1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Specc1Q5SXY1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Specc1Q5SXY1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Specc1Q5SXY1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Specc1Q5SXY1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Specc1Q5SXY1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Specc1Q5SXY1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Specc1Q5SXY1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Specc1Q5SXY1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Specc1Q5SXY1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Specc1Q5SXY1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Specc1Q5SXY1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Specc1Q5SXY1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Specc1Q5SXY1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Specc1Q5SXY1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Specc1Q5SXY1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Specc1Q5SXY1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Specc1Q5SXY1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Specc1Q5SXY1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Specc1Q5SXY1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Specc1Q5SXY1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Specc1Q5SXY1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Specc1Q5SXY1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Specc1Q5SXY1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Specc1Q5SXY1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Specc1Q5SXY1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Specc1Q5SXY1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Specc1Q5SXY1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Specc1Q5SXY1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Specc1Q5SXY1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Specc1Q5SXY1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Specc1Q5SXY1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Specc1Q5SXY1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Specc1Q5SXY1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Specc1Q5SXY1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Specc1Q5SXY1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Specc1Q5SXY1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Specc1Q5SXY1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Specc1Q5SXY1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Specc1Q5SXY1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Specc1Q5SXY1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Specc1Q5SXY1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Specc1Q5SXY1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Specc1Q5SXY1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Specc1Q5SXY1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Specc1Q5SXY1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Specc1Q5SXY1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Specc1Q5SXY1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Specc1Q5SXY1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Specc1Q5SXY1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Specc1Q5SXY1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Specc1Q5SXY1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Specc1Q5SXY1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Specc1Q5SXY1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Specc1Q5SXY1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Specc1Q5SXY1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Specc1Q5SXY1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Specc1Q5SXY1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Specc1Q5SXY1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Specc1Q5SXY1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Specc1Q5SXY1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Specc1Q5SXY1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Specc1Q5SXY1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Specc1Q5SXY1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Specc1Q5SXY1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Specc1Q5SXY1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Specc1Q5SXY1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Specc1Q5SXY1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Specc1Q5SXY1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Specc1Q5SXY1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Specc1Q5SXY1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Specc1Q5SXY1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Specc1Q5SXY1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Specc1Q5SXY1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Specc1Q5SXY1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Specc1Q5SXY1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Specc1Q5SXY1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Specc1Q5SXY1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Specc1Q5SXY1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Specc1Q5SXY1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Specc1Q5SXY1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Specc1Q5SXY1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Specc1Q5SXY1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Specc1Q5SXY1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Specc1Q5SXY1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Specc1Q5SXY1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Specc1Q5SXY1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Specc1Q5SXY1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Specc1Q5SXY1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 153.9 ms