Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW45

Mks1, Meckel syndrome type 1 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mks1Q5SW45 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mks1Q5SW45 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Mks1Q5SW45 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Mks1Q5SW45 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mks1Q5SW45 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mks1Q5SW45 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mks1Q5SW45 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mks1Q5SW45 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mks1Q5SW45 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mks1Q5SW45 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mks1Q5SW45 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mks1Q5SW45 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mks1Q5SW45 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mks1Q5SW45 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mks1Q5SW45 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mks1Q5SW45 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mks1Q5SW45 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mks1Q5SW45 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mks1Q5SW45 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Mks1Q5SW45 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mks1Q5SW45 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mks1Q5SW45 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Mks1Q5SW45 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mks1Q5SW45 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mks1Q5SW45 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mks1Q5SW45 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mks1Q5SW45 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mks1Q5SW45 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Mks1Q5SW45 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mks1Q5SW45 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Mks1Q5SW45 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mks1Q5SW45 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mks1Q5SW45 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mks1Q5SW45 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mks1Q5SW45 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mks1Q5SW45 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mks1Q5SW45 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mks1Q5SW45 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mks1Q5SW45 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mks1Q5SW45 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Mks1Q5SW45 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Mks1Q5SW45 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Mks1Q5SW45 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mks1Q5SW45 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Mks1Q5SW45 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Mks1Q5SW45 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mks1Q5SW45 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mks1Q5SW45 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mks1Q5SW45 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mks1Q5SW45 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mks1Q5SW45 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mks1Q5SW45 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Mks1Q5SW45 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mks1Q5SW45 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mks1Q5SW45 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mks1Q5SW45 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mks1Q5SW45 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mks1Q5SW45 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mks1Q5SW45 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mks1Q5SW45 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mks1Q5SW45 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mks1Q5SW45 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mks1Q5SW45 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mks1Q5SW45 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mks1Q5SW45 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mks1Q5SW45 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mks1Q5SW45 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mks1Q5SW45 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Mks1Q5SW45 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mks1Q5SW45 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mks1Q5SW45 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Mks1Q5SW45 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mks1Q5SW45 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mks1Q5SW45 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mks1Q5SW45 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mks1Q5SW45 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mks1Q5SW45 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mks1Q5SW45 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mks1Q5SW45 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Mks1Q5SW45 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mks1Q5SW45 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mks1Q5SW45 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mks1Q5SW45 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mks1Q5SW45 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mks1Q5SW45 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mks1Q5SW45 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mks1Q5SW45 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mks1Q5SW45 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mks1Q5SW45 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mks1Q5SW45 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mks1Q5SW45 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mks1Q5SW45 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mks1Q5SW45 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mks1Q5SW45 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mks1Q5SW45 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mks1Q5SW45 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mks1Q5SW45 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mks1Q5SW45 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Mks1Q5SW45 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mks1Q5SW45 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms