Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Psme4Q5SSW2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Psme4Q5SSW2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Psme4Q5SSW2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Psme4Q5SSW2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Psme4Q5SSW2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Psme4Q5SSW2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Psme4Q5SSW2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Psme4Q5SSW2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Psme4Q5SSW2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Psme4Q5SSW2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Psme4Q5SSW2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Psme4Q5SSW2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Psme4Q5SSW2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Psme4Q5SSW2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Psme4Q5SSW2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Psme4Q5SSW2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Psme4Q5SSW2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Psme4Q5SSW2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Psme4Q5SSW2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Psme4Q5SSW2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Psme4Q5SSW2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Psme4Q5SSW2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Psme4Q5SSW2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Psme4Q5SSW2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Psme4Q5SSW2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Psme4Q5SSW2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Psme4Q5SSW2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Psme4Q5SSW2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Psme4Q5SSW2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Psme4Q5SSW2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Psme4Q5SSW2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Psme4Q5SSW2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Psme4Q5SSW2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Psme4Q5SSW2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Psme4Q5SSW2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Psme4Q5SSW2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Psme4Q5SSW2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Psme4Q5SSW2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Psme4Q5SSW2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Psme4Q5SSW2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Psme4Q5SSW2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Psme4Q5SSW2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Psme4Q5SSW2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Psme4Q5SSW2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Psme4Q5SSW2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Psme4Q5SSW2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Psme4Q5SSW2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Psme4Q5SSW2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Psme4Q5SSW2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Psme4Q5SSW2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Psme4Q5SSW2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Psme4Q5SSW2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Psme4Q5SSW2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Psme4Q5SSW2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Psme4Q5SSW2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Psme4Q5SSW2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Psme4Q5SSW2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Psme4Q5SSW2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Psme4Q5SSW2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Psme4Q5SSW2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Psme4Q5SSW2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Psme4Q5SSW2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Psme4Q5SSW2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Psme4Q5SSW2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Psme4Q5SSW2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Psme4Q5SSW2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Psme4Q5SSW2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Psme4Q5SSW2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Psme4Q5SSW2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Psme4Q5SSW2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Psme4Q5SSW2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Psme4Q5SSW2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Psme4Q5SSW2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Psme4Q5SSW2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Psme4Q5SSW2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Psme4Q5SSW2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Psme4Q5SSW2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Psme4Q5SSW2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Psme4Q5SSW2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Psme4Q5SSW2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Psme4Q5SSW2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Psme4Q5SSW2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Psme4Q5SSW2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Psme4Q5SSW2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Psme4Q5SSW2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Psme4Q5SSW2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Psme4Q5SSW2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Psme4Q5SSW2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Psme4Q5SSW2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Psme4Q5SSW2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Psme4Q5SSW2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Psme4Q5SSW2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Psme4Q5SSW2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Psme4Q5SSW2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Psme4Q5SSW2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Psme4Q5SSW2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Psme4Q5SSW2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Psme4Q5SSW2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Psme4Q5SSW2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms