Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc88aQ5SNZ0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc88aQ5SNZ0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc88aQ5SNZ0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc88aQ5SNZ0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc88aQ5SNZ0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc88aQ5SNZ0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc88aQ5SNZ0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc88aQ5SNZ0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc88aQ5SNZ0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc88aQ5SNZ0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc88aQ5SNZ0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc88aQ5SNZ0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc88aQ5SNZ0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc88aQ5SNZ0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc88aQ5SNZ0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc88aQ5SNZ0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc88aQ5SNZ0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc88aQ5SNZ0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc88aQ5SNZ0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc88aQ5SNZ0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc88aQ5SNZ0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc88aQ5SNZ0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc88aQ5SNZ0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc88aQ5SNZ0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc88aQ5SNZ0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc88aQ5SNZ0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc88aQ5SNZ0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc88aQ5SNZ0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc88aQ5SNZ0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc88aQ5SNZ0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc88aQ5SNZ0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc88aQ5SNZ0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc88aQ5SNZ0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc88aQ5SNZ0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc88aQ5SNZ0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ccdc88aQ5SNZ0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ccdc88aQ5SNZ0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ccdc88aQ5SNZ0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ccdc88aQ5SNZ0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc88aQ5SNZ0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc88aQ5SNZ0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc88aQ5SNZ0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc88aQ5SNZ0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc88aQ5SNZ0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc88aQ5SNZ0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc88aQ5SNZ0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc88aQ5SNZ0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc88aQ5SNZ0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc88aQ5SNZ0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc88aQ5SNZ0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc88aQ5SNZ0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc88aQ5SNZ0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc88aQ5SNZ0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc88aQ5SNZ0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc88aQ5SNZ0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc88aQ5SNZ0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc88aQ5SNZ0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc88aQ5SNZ0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc88aQ5SNZ0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc88aQ5SNZ0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc88aQ5SNZ0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc88aQ5SNZ0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc88aQ5SNZ0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc88aQ5SNZ0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc88aQ5SNZ0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc88aQ5SNZ0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc88aQ5SNZ0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc88aQ5SNZ0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc88aQ5SNZ0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc88aQ5SNZ0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc88aQ5SNZ0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc88aQ5SNZ0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc88aQ5SNZ0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc88aQ5SNZ0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc88aQ5SNZ0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc88aQ5SNZ0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc88aQ5SNZ0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc88aQ5SNZ0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms